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棉花黄萎病菌(Verticillium dahliae Kleb)的群体遗传

The Population Genetic of Verticillium dahliae Kleb

【作者】 陈瑞辉

【导师】 王克荣;

【作者基本信息】 南京农业大学 , 植物病理学, 2000, 硕士

【摘要】 根据正交实验理论,设计一种优化RAPD各个反应组分获得理想图谱的最佳反应浓度方法,能够显著减少反应组分优化次数;大丽轮枝菌RAPD扩增最优反应组分浓度为:MgCl2 3.5M;dNTP 0.25mM;Primer 15pm;Taq酶1.5u;DNA 5ng。各反应组分为最优浓度下,单反应组分浓度的改变,RAPD扩增的电泳图谱发生改变;但在一定浓度范围内RAPD扩增的效果稳定,如DNA在2.5~15ng的范围内均能得到稳定、一致的图谱。实验表明,MCl2与dNTP浓度之比是影响RAPD扩增效果的最主要因素。 从126条随机引物中筛选到9条能产生多态性好、条带稳定的引物。用这9条引物对不同地理来源,营养体亲和性和寄主的198个棉花黄萎病菌进行RAPD扩增,共产生85条带,其中69条为多态性条带。 对已测定营养体亲和性的菌株,根据RAPD图谱计算出的菌株间的遗传相似性,进行聚类分析,可分为两组(RPG1,RPG2),第1营养体亲和群(VCGⅠ)和第2营养体亲和群(VCGⅡ)相应分别归入RPG1和RPG2;RPG1内差异较小,遗传变异量为0.0996,RPG2内差异较大,遗传变异量是0.1592;对已划分RPG而未知其VCG的菌株,进行营养体亲和性测定验证,除了一个菌株外,归在RPG1的菌株都属于VCGⅠ,归入RPG2的菌株均属于VCGⅡ;有5条RAPD扩增带在VCGⅠ内的出现频率大于0.96,其在VCGⅡ的出现频率均小于0.1,这5条带可以看作VCGⅠ的特征条带;结果表明,棉花黄萎病菌的营养体亲和性和特定引物的RAPD分组结果有很强的相关性。 对我国4个主产棉区河北、河南、江苏、山东群体分析表明,各省群体遗传相似性较高,总的遗传变异量为0.0947,其中72.5%由群体内的变异引起,12.5%由省内群体间引起,15%由群体间的变异引起;群体间的基因流动值为2.83,群体间,亚群体间均存在较高的基因流动;落叶型特征条带在各个亚群体内出现频率均很高,表明棉花黄萎病菌落叶型菌株在我国主产棉区的河北、河南、山东、江苏4省棉区分布广泛,并已成为或正在成为优势种群。 棉花黄萎病菌落叶型菌系和非落叶型菌系差异明显,且落叶型菌系之间相似性很高,推断落叶型菌系并非由非落叶型菌系毒性基因位点发生突变而来。

【Abstract】