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大连市2023年7株百日咳鲍特菌临床分离株全基因特征分析

Whole-genome characteristics analysis of 7 clinical Bordetella pertussis isolates from Dalian, 2023

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【作者】 侯君郎兴莹陈玉凤周林栾明春

【Author】 Hou Jun;Lang Xingying;Chen Yufeng;

【机构】 大连市疾病预防控制中心微生物检验科

【摘要】 目的 研究大连市2023年分离的的7株百日咳鲍特菌的全基因组序列特征以及对大环内酯类抗生素的敏感性,为防控百日咳提供科学依据。方法 通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和荧光定量PCR技术鉴定菌株。应用全基因组测序和E-test法分别测定基因组序列和对大环内酯类抗生素的敏感性。通过BLASTn比对分析主要毒力基因、疫苗相关基因及23S rRNA基因突变,并进行多位点序列分型(MLST)。利用IQ-TREE软件,将分离株与来自NCBI和NMDC数据库的97株国内外菌株(含疫苗株CS、标准株Tohama I)构建系统进化树。结果 7株临床分离株均对红霉素、阿奇霉素和克拉霉素表现为耐药,且其23S rRNA基因均携带A2047G突变。所有菌株均为ptxA1/ptxC2/ptxP3/prn2/fhaB1/fim2-1/fim3A*/tcfA-2/cyaA-2/vag8-2/opmQ-2/brkA-1/bapC-1型别,MLST分型为ST2型。与疫苗株CS相比,分离株在ptxA、ptxC、ptxP、prn及fim3这5个毒力基因的等位基因型上存在差异。系统进化分析显示,7株分离株亲缘关系相近,形成一独立进化分支;与疫苗株CS和标准株Tohama I遗传距离较远。结论 2023年大连地区百日咳鲍特菌临床分离株呈现出对大环内酯类抗生素高水平耐药,疫苗相关基因显著变异,以及由ptxP3基因型所预示的毒力增强等多重特征。未来应加强相关监测,为百日咳防控及新型疫苗开发提供更多理论支撑。

【基金】 大连市科技创新基金计划项目(2022JJ13SN082,2023JJ13SN040)
  • 【文献出处】 华南预防医学 ,South China Journal of Preventive Medicine , 编辑部邮箱 ,2026年01期
  • 【分类号】R446.5;R516.6
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