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牡丹YABBY基因家族的全基因组鉴定、表征及表达分析

Genome-wide identification,characterization and expression analysis of YABBY gene family in peony

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【作者】 刘仲阳杨斌张中起王连祥时晶晶吕令华苑红霞

【Author】 Liu Zhongyang;

【通讯作者】 王连祥;

【机构】 菏泽市农业科学院试验示范开发服务中心菏泽市农业科学院山东省菏泽市牡丹区林业局

【摘要】 对牡丹YABBY基因家族进行全基因组鉴定和表征,分析其在牡丹种子不同发育时期以及响应高温胁迫中的表达模式,以期为明确牡丹YABBY基因家族功能提供理论基础。通过生物信息学的方法分析牡丹YABBY基因的染色体定位、理化性质、基因结构、蛋白基序、启动子元件、基因复制、系统进化关系和表达模式等。结果表明,牡丹基因组有8个YABBY基因,其编码蛋白多为亲水性蛋白。牡丹YABBY基因家族存在1对由片段复制产生的旁系同源基因PosYABBY1~PosYABBY8。牡丹YABBY基因的启动子区域具有与生长发育、干旱胁迫、高温胁迫和激素响应相关的顺式调控作用元件。PosYABBY1、PosYABBY4和PosYABBY5在种子发育过程中优势表达,可能参与牡丹种子发育的调控过程。PosYABBY4、PosYABBY5和PosYABBY7受高温胁迫上调表达,而PosYABBY1、PosYABBY6和PosYABBY8受高温胁迫下调表达,它们可能参与到牡丹响应高温胁迫的调控过程。牡丹YABBY蛋白主要与植物形态建成、生长素调控和致病过程等的相关蛋白互作。研究结果可为牡丹YABBY基因功能的进一步验证和遗传利用提供数据参考。

【关键词】 牡丹YABBY鉴定表达特征蛋白互作
【基金】 山东省重点研发计划(2021年科技示范工程)(编号:2021SFGC1201);山东省生态农业技术体系菏泽综合试验站(编号:SDAIT-30-13)
  • 【文献出处】 江苏农业科学 ,Jiangsu Agricultural Sciences , 编辑部邮箱 ,2025年16期
  • 【分类号】S685.11
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