【摘要】 兰州鲇(Silurus lanzhouensis)是黄河中上游特有土著鱼类，其自然种群数量稀少，已被列入《中国物种红色名录》。为了解兰州鲇皮肤和脾2个重要免疫器官在免疫过程中发挥的不同功能，本研究以野生兰州鲇作为研究对象，对其皮肤和脾进行转录组测序分析。结果表明，兰州鲇的皮肤和脾中共有6 627个差异表达基因(DEG)。KEGG富集分析结果表明，共有59个DEG富集到Toll样受体信号通路、RIG-I样受体信号通路等11个免疫相关通路中。这表明兰州鲇的皮肤与脾的免疫功能有较大差异。通过DEG分析，还发现半乳糖凝集素3(galectin-3)及脂多糖诱导的肿瘤坏死因子(LITAF)2个先天免疫相关基因发生了显著的差异性表达。组织表达模式分析结果表明，galectin-3是兰州鲇皮肤高表达基因，而LITAF基因在6个组织中均有表达，显示出galectin-3主要在兰州鲇皮肤屏障的先天免疫中发挥着重要的免疫防御作用，而LITAF则广泛参与兰州鲇机体的免疫防御。通过多序列比对及蛋白质结构预测可知，Galectin-3与LITAF的氨基酸序列在硬骨鱼中是保守的。更多还原