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禽腺病毒8a型贵州株的Fiber蛋白遗传进化分析及其结构预测
Genetic Evolution Analysis and Structural Prediction of Fiber Protein of Fowl Adenovirus Type 8a Guizhou Strain
【摘要】 为了解禽腺病毒8a型(FAdV-8a)贵州株的纤突蛋白(Fiber)遗传进化情况及其结构特点，对前期构建的FAdV-8a贵州株Fiber蛋白pMD19-T-FAdV-8a-Fiber阳性重组质粒进行测序，应用DNAstar软件对Fiber蛋白进行氨基酸顺序分析并构建遗传进化树；分别利用在线软件ExPasy-ProtParam分析Fiber蛋白的理化性质，ExPasy-Protscale分析亲疏水性，TMHMM分析蛋白跨膜结构域，SOPMA2.0预测蛋白的二级结构，SWISS MODEL预测蛋白的三级结构，通过PyMOL Viewer 3.1输出预测的三级结构图。结果：FAdV-8a贵州株与FAdV-8b广东株的Fiber蛋白同源性最高且亲缘关系最近；FAdV-8a贵州株Fiber蛋白为疏水性蛋白，属于不稳定蛋白，不存在跨膜区；含有2种二级结构，其中延伸链共174个(占比33.33%),无规则卷曲348个(占比57.41%);三级结构模式图与其二级结构预测结果大致相同。
【关键词】 禽腺病毒；
FAdV-8a Fiber蛋白；
遗传进化；
蛋白质结构；
【基金】 “禽腺病毒8a型贵州株的分离与鉴定”大学生创新创业训练项目（gzusc2023025号）;“动物病原分子特征与致病机制研究”贵州省科技支撑计划项目（黔科合平台人才[2021]5646号）;“安卡拉病毒贵州株生物学特性与致病机理研究”贵州省科技支撑计划项目（黔科合基础[2020]1Y409）
- 【文献出处】 贵州畜牧兽医 ,Guizhou Journal of Animal Husbandry & Veterinary Medicine , 编辑部邮箱 ,2025年03期
- 【分类号】S852.65
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