基于生物信息学及实验识别脓毒症急性肺损伤中中性粒细胞诱捕网的核心标志物

【摘要】 目的：基于生物信息学和实验的方法探究中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）在脓毒症急性肺损伤（ALI）中的核心标志物及可能的作用机制。方法：芯片数据GSE10474及NETs基因集分别从GEO数据库及文献中下载，利用perl语言软件提取GSE10474数据集中的基因表达量，利用R语言软件进行差异分析，同时对差异基因表达（DEGs）进行基因本体（GO）富集分析、京都基因和基因组数据库（KEGG）通路分析及基因集富集（GSEA）分析，最后建立小鼠脓毒症急性肺损伤（ALI）模型，通过实时荧光定量PCR(qPCR)对DEGs进行验证。结果：经过筛选获得2个NETs DEGs，分别为外核苷三磷酸二磷酸水解酶4(ENTPD4)及磷酸二酯酶4B(PDE4B),GO及KEGG结果提示两者主要富集于核苷酸代谢途径，GSEA分析结果提示PDE4B及ENTPD4分别主要富集于细胞因子间相互作用通路及T细胞受体信号转导通路等与炎症及免疫相关通路。动物验证实验中，与假手术组小鼠相比，脓毒症ALI组小鼠肺损伤评分升高，只有PDE4B在脓毒症ALI组的信使核糖核酸（mRNA）表达明显升高（P<0.05）。结论：PDE4B可作为脓毒症ALI中NETs形成和释放的核心标志物，并有望成为该病潜在的免疫治疗靶点。更多还原