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全基因组关联分析在小麦育种研究中的应用

Application of genome-wide association studies in wheat breeding

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【作者】 李鹏程汪军成姚立蓉司二静杨轲孟亚雄马小乐李葆春尚勋武王化俊

【Author】 LI Pengcheng;WANG Juncheng;YAO Lirong;SI Erjing;YANG Ke;MENG Yaxiong;MA Xiaole;LI Baochun;SHANG Xunwu;WANG Huajun;State Key Laboratory of Aridland Crop Science/Gansu Provincial Key Laboratory of Crop Improvement & Germplasm Enhancement;College of Agronomy, Gansu Agricultural University;College of Life Sciences and Technology, Gansu Agricultural University;

【通讯作者】 李葆春;王化俊;

【机构】 省部共建干旱生境作物学国家重点实验室/甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室甘肃农业大学农学院甘肃农业大学生命科学技术学院

【摘要】 全基因组关联分析(GWAS)是高效检测不同物种复杂性状的遗传变异,寻找与之相关联标记或基因的一种分析方法,在小麦(Triticum aestivum)育种中应用广泛。本文阐述了关联分析群体选择、基因型分型、高通量表型鉴定和GWAS统计模型四个方面,查阅近10年来小麦GWAS相关研究的中英文文献,从农艺性状、品质性状、生物和非生物胁迫等研究方面进行归纳叙述。讨论并展望GWAS存在的问题以及未来在小麦育种领域的应用前景,以期为进一步利用GWAS进行小麦遗传改良研究提供依据。

【Abstract】 Genome-wide association studies(GWAS) is an analytical method widely used in wheat(Triticum aestivum) breeding for detecting genome-wide genetic variation in complex traits across species and finding associated markers or genes. The paper describes population selection for association analysis, genotyping, high-throughput phenotyping, and statistical models, as well as a review of Chinese and English references on GWAS-related studies in wheat conducted over the last decade years to summarize and describe the studies in terms of agronomic, quality, and biotic and abiotic stress-related traits. Here, existing GWAS problems and potential applications in wheat breeding were discussed and prospected in order to provide a foundation and reference for future research on wheat genetic improvement using GWAS.

【基金】 国家现代农业产业技术体系项目(CARS-05-04B-2);甘肃省教育厅产业支撑计划项目(2021CYZC-12);国家自然科学基金项目(31860377);甘肃农业大学伏羲青年英才计划(Ganfx-03Y06);甘肃省科技支撑计划项目(1604NKCA052-2);2023年甘肃省级重点人才项目;甘肃省农业科技支撑项目(KJZC-2023-2);甘肃省优秀研究生“创新之星”项目(2022CXZXB-028);甘肃省科技重大专项(17ZD2NA016)
  • 【文献出处】 植物生理学报 ,Plant Physiology Journal , 编辑部邮箱 ,2023年03期
  • 【分类号】S512.1
  • 【下载频次】166
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