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利用SNP标记划分玉米地方种质杂种优势类群

Heterotic Grouping of 100 Local Maize Germplasm by SNP Markers

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【作者】 张培风任帅孙佩王蕊张瑞平王文洁马朝阳李合顺王学军周联东

【Author】 ZHANG Pei-feng;REN Shuai;SUN Pei;WANG Rui;ZHANG Rui-ping;WANG Wen-jie;MA Chao-yang;LI He-shun;WANG Xue-jun;ZHOU Lian-dong;Xinxiang Academy of Agricultural Sciences of Henan Province;

【通讯作者】 周联东;

【机构】 河南省新乡市农业科学院

【摘要】 利用1021个SNP标记对20份参照物和100份地方种质资源的基因型进行分析,结果表明,1021个SNP标记在供试材料中的平均多态性信息含量(PIC)为0.295,杂合率在0~29.3%之间,平均杂合率为2.5%;缺失率在0~19.4%之间,平均缺失率为1.7%。120份地方种质间遗传距离变化范围为0.453~0.653。根据遗传距离信息,通过NJ聚类分析,将供试的120份地方种质划分为7个杂种优势群,划群结果和系谱来源具有较好的一致性,100份河南地方种质全部聚为一类,被划分为黄源群,表明来自河南的地方种质遗传背景相同,亲缘关系较近,纯合度较高。其中遗传距离最小的2个地方种质资源是短腿玉米和黄马牙,纯合度较高,遗传关系最近,遗传距离为0.010。研究结果可作为杂优模式的选择依据。

【关键词】 玉米SNP标记类群划分杂种优势群
【基金】 河南省科技攻关项目(212102110283)
  • 【文献出处】 中国种业 ,China Seed Industry , 编辑部邮箱 ,2023年02期
  • 【分类号】S513
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