绵羊MSR1克隆及其序列分析

【摘要】 为了解绵羊巨噬细胞清道夫受体1(Macrophage Scavenger Receptor 1,MSR1)基因的生物学信息特征，本研究对绵羊MSR1进行了克隆鉴定，与其他物种的MSR1氨基酸序列进行比对、构建进化树，并进行生物信息分析，预测了MSR1的理化性质。结果显示：绵羊MSR1基因ORF区全长1 362 bp，编码453个氨基酸，分子量约为50 kDa，构建了MSR1真核表达载体；绵羊MSR1与山羊、羚羊、马鹿、水牛、白鲸、猪、人、家兔、小鼠的同源性分别为98.90%、96.03%、93.16%、93.16%、81.28%、78.81%、74.17%、73.51%、63.77%，同属于牛科动物的序列同源性在90%以上，进化树上在同一分支；该蛋白分子式为C2188H3473N629O680S19，理论等电点为6.00，蛋白质性质为弱酸性，51～73号氨基酸为跨膜结构，有7个潜在的糖基化位点和多个磷酸化位点，存在2个棕榈酰化位点和5个乙酰化位点，169～180位氨基酸序列区域为优势抗原决定簇。研究结果为以后研究绵羊MSR1的功能奠定了基础。更多还原