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药食同源蔬菜赤苍藤SCoT分子标记体系的优化及引物筛选

Optimization of scot molecular marker system and primer screening of Erythropalum scandens Bl.-A vegetable of affinal drug and diet

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【作者】 杨天为黄诗宇张尚文高曼熔张向军李婷庾韦花蒙平石前

【Author】 YANG Tianwei;HUANG Shiyu;ZHANG Shangwen;GAO Manrong;ZHANG Xiangjun;LI Ting;YU Weihua;MENG Ping;SHI Qian;Biotechnology Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Science;Agricultural College of Guangxi University;

【通讯作者】 张尚文;

【机构】 广西壮族自治区农业科学院生物技术研究所广西大学农学院

【摘要】 笔者以24份不同来源地的野生赤苍藤种质为试验材料,采用L9(33)正交试验对赤苍藤SCoT-PCR反应体系进行优化,并通过优化后的体系进行引物筛选,结果表明,PCR体系中各因素对多态性结果的影响程度排序为DNA模板量>引物用量>2×Taq Master Mix用量。最佳反应体系(20μL)为1 μL DNA模板(50 ng·μL-1)、1.2 μL引物(10 μmoL·μL-1)、10 μL 2×Taq Master Mix和7.8 μL ddH2O。通过该体系从36条SCoT引物中筛选出14条稳定性好、多态性高的引物,并确定了最佳退火温度。该体系的建立和引物的筛选将为后续开展赤苍藤种质资源收集与保护、遗传多样性研究和分子育种提供参考依据。

【Abstract】 In this study, the SCoT-PCR reaction system of Erythropalum scandens Bl. was optimized by L9(33)orthogonal design,and 24 samples from different origins were used as experimental materials for primer screening and system verification. The factors affecting polymorphism were listed as follows, the amount of DNA template > the amount of primers > the amount of 2×Taq Master Mix, and the best reaction system(20 μL)was 1 μL DNA template(50 ng·μL-1), 1.2 μL primer(10 μmoL·μL-1), 10 μL 2×Taq Master Mix and 7.8 μL ddH2O. Totally 14 primers with good stability and high polymorphism were selected from 36 SCoT primers, and the optimal renaturation temperature was determined. The establishment of the system and the screening of primers will provide a reference for the subsequent collection and protection of germplasm resources, genetic diversity research and molecular breeding of Erythropalum scandens.

【基金】 广西重点研发计划(桂科AB21220042);广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2017YM27);广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2022JM51);广西特色作物试验站“广西隆安中草药试验站”(桂TS2022002);广西水土保持学会重点领域创新项目(202009001)
  • 【文献出处】 中国瓜菜 ,China Cucurbits and Vegetables , 编辑部邮箱 ,2023年01期
  • 【分类号】S567.19
  • 【下载频次】25
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