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基于位置信息的DNA序列特征提取

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【作者】 陈煜元周小安

【机构】 深圳大学

【摘要】 <正>DNA序列的分类是生物信息学的主要研究任务之一,如何提取DNA序列中的特征是影响分类精度的重要因素。为了更好地保留序列中碱基的信息,本文提出了一种基于碱基距离和相关性的特征提取方法。以H1N1、H5N1、COVID-19等6种病毒作为研究对象,将DNA序列转化为特征向量,并用KNN算法对冠状和非冠状病毒进行分类。实验结果表明该方法能提高分类的准确率。据估计地球上约有1000万~1亿种生物,如此庞大的数据使得生物分类面临着巨大挑战[1],因此DNA序列的分类成为了人们的研究热点,也是当前生物信息学的主要研究任务之一。

【基金】 深圳市高等院校稳定支持计划项目(89402060020)
  • 【文献出处】 数字技术与应用 ,Digital Technology & Application , 编辑部邮箱 ,2023年01期
  • 【分类号】TP181;Q811.4
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