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基于线粒体D-loop区分析安徽省5个翘嘴鳜养殖群体的遗传多样性
Study on genetic diversity of five cultured populations of Siniperca chuatsi based on D-loop region of mitochondrial DNA
【摘要】 为研究安徽省鳜鱼的遗传多样性,对安徽省内5个鳜鱼养殖群体共125个样本的线粒体D-loop区进行了扩增和测序分析。试验最终共获得125条长度为858 bp的D-loop区序列,共检出260个变异位点,包括77个简约信息位点和183个单核苷酸变异位点;碱基平均含量为T(29.3%)、C(20.6%)、A(33.8%)和G(16.2%),具有明显的(A+T)碱基偏移。5个群体的遗传多样性较低(Hd, mean=0.596,Pi, mean=0.0 053),可能经历了瓶颈事件。此外,通过对群体遗传结构及邻接法系统发育树的分析发现,5个养殖群体未表现出明显地理聚集,不同群体间有少量个体混合。群体变异主要来自于群体内部而非群体间。本研究可为鳜鱼种质资源的保护和恢复提供理论依据。
【关键词】 鳜(Siniperca chuatsi);
线粒体基因组;
D-loop区;
遗传多样性;
【基金】 农业农村部物种品种资源保护项目(渔业)(编号:kj20180187);安徽省水产产业体系建设专项(编号:[2016]84)
- 【文献出处】 江苏农业科学 ,Jiangsu Agricultural Sciences , 编辑部邮箱 ,2021年09期
- 【分类号】S917.4
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