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健康和患病克氏原螯虾肠道微生物群落结构和多样性分析

Characterizing the Composition and Biodiversity of Intestinal Microbiota between Healthy and Sick Procambarus clarkii

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【作者】 张立强李媛邓平魏朝辉丁桂珍罗杨志喻运珍艾桃山

【Author】 Zhang Li-qiang;Li Yuan;Deng Ping;

【通讯作者】 邓平;

【机构】 武汉市农业科学院水产科学研究所武汉中博水产生物技术有限公司武汉市环境检测中心

【摘要】 为探索健康克氏原螯虾(Procambarus clarkii)与患病克氏原螯虾在肠道微生物菌群结构和多样性方面的差异,采集健康虾(对照组)和患病虾(患病组)样品,通过Illumina高通量测序技术测定样品虾的肠道微生物组成,并利用Simpson指数评估样品中微生物的多样性。结果显示:所有样品共检出400个种水平上的OTUs(operational taxonomic units),归属于25个门(phylum);对照组肠道微生物的优势菌为厚壁菌门(Firmicutes),而患病组的优势菌为变形菌门(Proteobacteria)。进一步分析表明,患病组变形菌门的占比显著高于对照组,Simpson指数提示,患病组的生物多样性较对照组显著下降(P<0.05)。结果表明,患病克氏原螯虾肠道微生物中变形菌门的占比显著上升,生物多样性显著下降(P<0.05)。

【基金】 国家特色淡水鱼产业技术体系(CARS—46)
  • 【文献出处】 水产科技情报 ,Fisheries Science & Technology Information , 编辑部邮箱 ,2020年01期
  • 【分类号】S945.4
  • 【被引频次】9
  • 【下载频次】432
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