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香委陵菜的叶绿体全基因组

The Complete Chloroplast Genome of Potentilla suavis(Rosaceae:Potentilleae)

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【作者】 李琴琴张志平哈斯巴根

【Author】 LI Qin-qin;ZHANG Zhi-ping;Khasbagan;College of Life Science and Technology,Inner Mongolia Normal University;College of Computer Science and Technology,Inner Mongolia Normal University;

【通讯作者】 哈斯巴根;

【机构】 内蒙古师范大学生命科学与技术学院内蒙古师范大学计算机科学技术学院

【摘要】 报道香委陵菜(Potentilla suavis)的叶绿体全基因组。香委陵菜的叶绿体基因组为环状分子,全长155 044 bp。基因组呈现典型的四分体结构:包括一个大单拷贝区(large single copy,LSC)、一个小单拷贝区(small single copy,SSC)和1对被大小单拷贝区隔开的反向重复区(inverted repeats,IRa和IRb),长度分别为84 334 bp、18 452 bp和26 129 bp。香委陵菜叶绿体基因组共有129个基因,包括84个蛋白质编码基因,37个转运RNA(tRNA)基因和8个核糖体RNA(rRNA)基因,其中17个基因含有2个拷贝。系统发育分析表明,在当前类群取样下香委陵菜与紫花委陵菜(Potentilla purpurea)为姐妹群。

【Abstract】 The complete chloroplast genome of Potentilla suavis is reported and characterized in this study.The chloroplast genome of P.suavis was a circular form with a size of 155 044 bp in length.The genome presented a typical quadripartite structure composed of a pair of inverted repeats(IRa and IRb) of 26 129 bp separated by a large single copy(LSC) region of 84 334 bp and a small single copy(SSC) region of 18 452 bp.The genome contained a set of 129 genes,including 84 protein-coding genes,37 tRNA genes,and eight rRNA genes,in which 17 were duplicated.Phylogenetic analysis indicated that P.suavis was sister to P.purpurea in current sampling.

【基金】 内蒙古自然科学基金资助项目(2018MS03039)
  • 【文献出处】 内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版) ,Journal of Inner Mongolia Normal University(Natural Science Edition) , 编辑部邮箱 ,2020年06期
  • 【分类号】S682.19
  • 【被引频次】1
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