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豫西黑猪线粒体COXI基因的扩增和系统发生分析

Amplification and Phylogenetic Analysis of Mitochondrial Gene COXI in Yuxi Black Pig

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【作者】 周武杨又兵王阳阳王丽徐硕辉邢沛和俊豪卞军平庞有志

【Author】 ZHOU Wu;

【通讯作者】 杨又兵;

【机构】 河南科技大学动物科技学院洛阳市动物遗传育种重点实验室

【摘要】 豫西黑猪作为一个极具发展潜力的地方品种,其种质资源面临着基因混杂的风险。通过对豫西黑猪的线粒体COXI基因进行PCR扩增、测序,并与其他22种不同猪种的COXI基因进行序列比对,采用最大似然法(ML法)和邻接法(NJ法)建立系统发育树,探究其与其他猪种之间的遗传变异及种系发育关系。结果表明,23个猪种该基因序列保守位点和变异位点分别占总位点的96.5%和3.5%,不同猪种间线粒体COXI基因的相似度均在96.5%以上。豫西黑猪线粒体COXI基因表现出明显A、T碱基偏好性。系统发育树和遗传距离结果显示,豫西黑猪种内遗传距离较近,并且与杜洛克猪的遗传距离较近,说明豫西黑猪与杜洛克猪之间存在基因混杂情况。

【关键词】 豫西黑猪线粒体COXI基因NJ树ML树
【基金】 河南科技大学大学生科研训练项目(2019403);国家自然科学基金委员会-河南省人民政府人才培养联合基金项目(U1304324)
  • 【文献出处】 现代农业科技 ,Modern Agricultural Science and Technology , 编辑部邮箱 ,2020年07期
  • 【分类号】S828.2
  • 【被引频次】1
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