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猪CBR1基因不同拷贝形式克隆及其多态性分析  
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【英文篇名】 Cloning of Porcine CBR1 Gene's Different Copy Forms and Analysis of Its Polymorphism
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【作者】 齐传翔; 徐奎; 牟玉莲; 杨述林; 李奎; 吴添文;
【英文作者】 QI ChuanXiang; XU KUI; MU YuLian; YANG ShuLin; LI Kui; WU TianWen; Institute of Animal Science; Chinese Academy of Agricultural Sciences; College of Veterinary Medicine; Yangzhou University/Jiangsu Co-innovation Center for Prevention and Control of Important Animal Infectious Diseases and Zoonoses; Shandong Lansi Seeds Industry Co.; Ltd;
【作者单位】 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所; 扬州大学兽医学院/江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心; 山东蓝思种业股份有限公司;
【文献出处】 中国农业科学 , Scientia Agricultura Sinica, 编辑部邮箱 2018年 08期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 ; 羰基还原酶1基因; 重测序; de-novo组装;
【英文关键词】 swine; CBR1 gene; re-sequencing; de-novo assembly;
【摘要】 【目的】获得猪CBR1基因不同拷贝形式编码区序列,了解其序列特征,分析猪CBR1基因不同拷贝形式的多态性及其与繁殖性能间的相关性。【方法】以五指山猪睾丸组织的c DNA为模板,采用克隆测序技术获得猪CBR1基因不同拷贝形式编码区序列。利用DNASTAR对CBR1不同拷贝形式编码的氨基酸序列进行分析。利用DNAMAN软件分析猪CBR1基因不同拷贝形式间的同源性,及其与多个哺乳动物间的同源性。利用Ex Pa Sy提供的Protparam在线软件分析猪CBR1基因不同拷贝的蛋白质理化特性。采集136头大白和47头长白繁殖母猪耳组织样,提取基因组DNA,采用PCR-测序检测猪CBR1基因不同拷贝形式的多态位点,分析其与繁殖性能的相关性。【结果】猪CBR1基因的3个不同拷贝形式均编码3个外显子,其编码区序列全长分别为870,870和846bp,其12—18位氨基酸残基均为保守的GlyXXXGly XGly序列,符合CBRs家族的结构特性。同源性比对结果显示,CBR1基因不同拷贝形式的CDS序列同源性达87%以上,不同哺乳动物间的CBR1基因的CDS序列同源性达82%以上,可见哺乳动物CBR1基因在进化过程中比较保守。C...
【英文摘要】 【Objective】 In order to obtain and analysis the different copy forms of CBR1 gene coding region, and analysis the correlation between polymorphism and reproductive performance of different copy forms of CBR1 gene in pigs.【Method】 Based on the c DNA of the Wuzhishan pig's testis, the different copy sequences of CBR1 gene were obtained by cloning sequencing technology. The amino acid sequences encoded by different copy forms of CBR1 gene were analyzed by DNASTAR software. Homology between different copy forms...
【基金】 国家自然科学基金(31201780); 国家重大科学研究计划(2015CB943101)
【更新日期】 2018-05-24
【分类号】 S828
【正文快照】 江苏扬州225009;3山东蓝思种业股份有限公司,山东日照276800)Cloning of Porcine CBR1 Gene’s Different Copy Forms and Analysisof Its PolymorphismQI Chuan Xiang1,2,XU KUI1,3,MU Yu Lian1,YANG Shu Lin1,LI Kui1,WU Tian Wen1(1 Institute of Animal Science,Chinese Ac

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