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亚洲棉ARF基因家族全基因组鉴定与分析  
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【英文篇名】 Gome-wide identification and analysis of ARF gene family in Gossypium arboretum L.
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【作者】 冯庭; 司国阳; 李国辉; 郭宁; 蔡永萍;
【英文作者】 FENG Ting; SI Guoyang; LI Guohui; GUO Ning; CAI Yongping; School of Life Sciences; Anhui Agriculture University;
【作者单位】 安徽农业大学生命科学学院;
【文献出处】 生物信息学 , Chinese Journal of Bioinformatics, 编辑部邮箱 2018年 01期  
期刊荣誉：ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 亚洲棉; ARF; 进化关系;
【英文关键词】 Gossypium arboretum L.; ARF; Evolution relationship;
【摘要】 生长素响应因子(ARF)是植物中可以特异性结合生长素应答基因启动子的转录因子,在植物的生长发育中起着重要的调控作用。为了更好的了解亚洲棉中ARF基因家族的种类和数量,本文利用生物信息学的方法,分析了亚洲棉基因组中ARF基因的种类、进化关系、物理定位以及基因的结构和保守基序。结果表明在亚洲棉基因组中发现并初步确定了29个ARF基因,命名为Ga ARF,通过基因定位发现除在2、3、5、11号染色体上没有ARF基因外,其他染色体上都有ARF基因存在;而且在10号染色体上还存在着基因簇;进化树分析表明,亚洲棉部分ARF蛋白和已知功能的拟南芥聚类到一起;表达模式分析显示,不同组织不同处理条件下ARF基因的表达存在差异。
【英文摘要】 Auxin response factor( ARF) is an important transcription factor that can specifically bind auxin responsive gene promoter in plants,and influences the plant growth and development. To better understand the type and quantity of ARF gene families in Gossypium arboretum,we used the method of bioinformatics to analyze the structure types physical mapping of genes and conserved motifs of genome in Gossypium arboretum. The results show that 29 ARF genes,named Ga ARF were identified in the genome of Gossypium arb...
【基金】 安徽省生物学重点学科(2014SWQJ009)
【更新日期】 2018-05-10
【分类号】 Q943.2;S562
【正文快照】 转录因子对植物的生长、发育和响应外界环境的变化起着重要的作用[1],生长素响应因子(ARF)就是其中的一类,生长素与植物种子的萌发,器官的形成和向性反映等诸多生理过程有密切联系[2]。生长素响应因子能够与生长素响应原件TGTCTC序列特异性结合并调控生长素响应基因的表达[3],?

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