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【英文篇名】 |
Ontology: Foundation of biomedical big data and precision medicine research |
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【下载频次】 |
★★★★★ |
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【作者】 |
何勇群;
余红;
杨啸林;
邵晨;
周伟;
朱彦;
王海河;
刘清平;
谢江安;
ZHENG Jie;
朱伟民; |
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【英文作者】 |
HE Yongqun;
YU Hong;
YANG Xiaolin;
SHAO Chen;
ZHOU Wei;
ZHU Yan;
WANG Haihe;
LIU Qingping;
XIE Jiang'an;
ZHENG Jie;
ZHU Weimin;
Institute of Basic Medical Sciences;
Chinese Academy of Medical Sciences;
University of Michigan Medical School;
Guizhou University Medical College;
Guizhou Province People’s Hospital;
National Scientific Data Sharing Platform for Population and Health;
Institute of Information on Traditional Chinese Medicine;
China Academy of Chinese Medical Sciences;
Daqing Branch of Harbin Medical University;
Guang...; |
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【作者单位】 |
中国医学科学院基础医学研究所;
University of Michigan Medical School;
贵州大学医学院;
贵州省人民医院;
国家人口与健康科学数据共享服务平台;
中国中医科学院中医药信息研究所;
哈尔滨医科大学大庆校区;
广州中医药大学;
重庆邮电大学;
University of Pennsylvania Perelman School of Medicine;
国家蛋白质科学中心北京凤凰中心; |
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【文献出处】 |
生物信息学
, Chinese Journal of Bioinformatics, 编辑部邮箱
2018年 01期
期刊荣誉：ASPT来源刊 CJFD收录刊 |
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【中文关键词】 |
可控词表;
本体;
基因本体;
生物医学大数据;
精准医学;
本体中国; |
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【英文关键词】 |
Controlled terminology;
Ontology;
Gene ontology;
Biomedical big data;
Precision medicine;
Onto-China; |
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【摘要】 |
在最近兴起的生物医学大数据和精准医学研究中,本体正发挥着不可替代的作用。但一大部分人对本体的定义、类型与应用比较混淆。这篇综述对这些问题进行了回答。具体而言,本体使用人和计算机都可以理解的术语及关系集来表述各种实体/概念以及它们之间关系。根据本体的作用,本体可分为三类:具有多关系模型的增强版控制术语集,反映某知识域的本体知识系统,和对元数据在语义上的约束与标准化的元数据本体。基于这些作用,本体被广泛地应用于生物医学数据的标准化、整合、检索与分析,已经知识的挖掘。当代本体学的研究发展迅速,我国刚刚起步,机遇与挑战并存。广泛地开展国内与国际有关本体的合作研究,将促进国内生物医学本体领域研究水平的整体提升,提高生物与临床科研大数据整合与精准医学研究的能力。 |
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【英文摘要】 |
Ontology plays an unreplaceable role in the recently emerging big data and precision medicine research.However,the definition,subtypes and applications of ontology remain unclear for the majority of researchers. The goal of this review is to address these issues. Specifically,an ontology is a set of human-and computer readable terms,or concepts,and the relations that represent entities and their relationships in a specific domain. Based on functions,ontologies can be classified into three types: as an enhan... |
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【基金】 |
美国NIH LINCS(U54HL127624)eDSR课题;
贵阳市科技计划筑科合同(20151001社78号,20161001号);
北京市自然科学基金资助项目(7174328);
国家重点研发计划资助(2017YFC0908404);
国际科技合作专项(S2014ZR0005) |
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【更新日期】 |
2018-05-10 |
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【分类号】 |
R-05 |
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【正文快照】 |
HE Yongqun1,2*,余红3,杨啸林1,邵晨1,周伟4,朱彦5,王海河6,刘清平7,谢江安8,ZHENG Jie9,朱伟民10(1.中国医学科学院基础医学研究所,北京100005;2.University of Michigan Medical School,Ann Arbor,MI,48109 USA;3.贵州大学医学院,贵州省人民医院,贵阳550002;4.国家人口与健康 |
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