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【英文篇名】 |
Comparison of Five Kits for Cell-free DNA Extraction |
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【下载频次】 |
★★★★★ |
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【作者】 |
李雪莲;
齐谢敏;
邹秉杰;
黄青;
宋沁馨;
周国华; |
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【英文作者】 |
LI Xuelian;
QI Xiemin;
ZOU Bingjie;
HUANG Qing;
SONG Qinxin;
ZHOU Guohua;
Key Laboratory of Drug Quality Control and Pharmacovigilance of Ministry of Education;
China Pharmaceutical University;
Department of Pharmacology;
Nanjing General Hospital; |
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【作者单位】 |
药物质量与安全预警教育部重点实验室中国药科大学;
南京总医院药理科; |
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【文献出处】 |
中国现代应用药学
, Chinese Journal of Modern Applied Pharmacy, 编辑部邮箱
2018年 08期
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 CJFD收录刊 |
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【中文关键词】 |
试剂盒;
血浆游离DNA;
实时荧光定量PCR;
回收率;
提取效率; |
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【英文关键词】 |
kit;
cell-free DNA;
real-time quantitative PCR;
recovery;
extraction efficiency; |
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【摘要】 |
目的筛选一种操作简单、快捷、成本低、提取效率高、易富集到短片段的血浆游离DNA(cell-free DNA,cf DNA)提取试剂盒。方法向健康人血浆中投入一定量的6种长度各异的非人源DNA,经5种试剂盒提取后,使用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,q PCR)定量,比较5种试剂盒提取回收率的差异。用上述试剂盒提取乳腺癌患者血浆cf DNA,并对其中6种不同长度的Kras基因片段进行定量,比较5种试剂盒对cf DNA提取效率的差异。结合提取成本、耗时等综合评价,最终筛选出最优试剂盒。结果试剂盒1对>157 bp的片段回收率最高(75.5%~87.4%),提取总cf DNA含量最高[(154.0±10.1)copies·μL-1血浆)],每个样本提取成本为274元、耗时73 min,但提取过程需要真空泵。试剂盒2对<157 bp的片段回收率在5个试剂盒中最高(31.8%~33.7%),对<145 bp的cf DNA提取效率最高[(81.7±6.2)copies·μL-1血浆)],提取总cf DNA含量[(137.1±13.9)copies·μL-1血浆)]仅次于试剂盒1,... |
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【英文摘要】 |
OBJECTIVE To screen a cell-free DNA(cf DNA) extraction kit which is compatible with the requirements of easy-processing, speediness, low price, and high extraction efficiency to enrich short DNA fragments. METHODS In order to compare recovery among five DNA extraction kits, six kinds of non-human derived DNA fragments were added into healthy human plasma. Those DNA fragments were extracted by five DNA extraction kits and then quantified by real-time quantitative PCR(q PCR). Next, plasma cf DNA originated fr... |
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【基金】 |
国家自然科学基金项目(81673390,81603219,81603196);
江苏省重点研发计划(社会发展)项目(BE2016745);
江苏省基础研究计划(自然科学基金)项目(BK20151445);
药物质量与安全预警教育部重点实验室资助项目(DQCP2017MS01);
江苏省青蓝工程 |
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【更新日期】 |
2018-08-28 |
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【分类号】 |
R440 |
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【正文快照】 |
引用本文:李雪莲,齐谢敏,邹秉杰,等.5种试剂盒对血浆游离DNA提取效果的比较[J].中国现代应用药学,2018,35(8):1119-1123.1948年,Mandel和Metais首次报道了人类血液中游离DNA(cell-free DNA,cf DNA)的存在[1]。大量研究发现,cf DNA含量增高对肿瘤早期诊断[2]、无创产前诊断[3]、 |
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