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构建CRISPR-Cas9介导的耻垢分枝杆菌基因组高效删除系统  
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【英文篇名】 CRISPR-Cas9-assisting efficient and sequential genome deletions in Mycobacterium smegmatis
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【作者】 邢述永; 路志群; 夏海洋; 邓自发; 王兆慧; 周蓉; 陈艳红;
【英文作者】 XING Shu-Yong; LU Zhi-Qun; XIA Hai-Yang; DENG Zi-Fa; WANG Zhao-Hui; ZHOU Rong; CHEN Yan-Hong; School of Life Sciences; Nantong University; School of Life Science; Taizhou University;
【作者单位】 南通大学生命科学学院; 台州学院生命科学学院;
【文献出处】 微生物学通报 , Microbiology China, 编辑部邮箱 2018年 12期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 CRISPR-Cas9; 耻垢分枝杆菌mc2155; DNA无痕敲除;
【英文关键词】 CRISPR-Cas9; Mycobacterium smegmatis mc2155; Genome manipulation;
【摘要】 【背景】耻垢分枝杆菌具有生长迅速和非致病性的特点,可作为结核分枝杆菌致病机理研究替代菌株和类固醇激素生产的工程菌,但目前耻垢分枝杆菌中缺乏高效率的基因组敲除方法。【目的】基于CRISPR-Cas9介导的定点、高效的DNA切割能力,构建耻垢分枝杆菌染色体DNA片段无痕敲除系统。【方法】构建了包含四环素诱导型启动子驱动的密码子优化的cas9基础载体pCas9101,在双侧同源臂长度约为1 kb条件下选用合适的gRNA表达模块,分别测试了对耻垢分枝杆菌mc2155染色体上的3β-羟基类固醇脱氢酶基因(MSMEG_5228,1 071 bp)和胆固醇降解基因簇(MSMEG_5990-MSMEG_6043,约48kb)敲除效率,使用相同大小的同源臂以经典p2NIL-pGOAL方法进行对照,并计算效率。【结果】使用CRISPR-Cas9方法对耻垢分枝杆菌mc2155的3β-羟基类固醇脱氢酶基因敲除效率为22%,胆固醇降解基因簇敲除效率也达到18%,两者连续敲除效率为4%。但对照p2NIL-pGOAL方法未能获得目标DNA片段敲除的菌株。【结论】本文建立的基于CRISPR-Cas9的耻垢分枝杆菌基因组无痕敲除系统显示出较高...
【英文摘要】 [Background] For its fast growing and non-pathogenic property, Mycobacterium smegmatis is used as a model strain for pathogenic Mycobacterium tuberculosis and a workhorse to produce steroid hormones. But it lacks efficient genome deletion system. [Objective] In this study, we established a high efficiency genome deletion system in M. smegmatis assisted by CRISPR-Cas9. [Methods] The Cas9 backbone plasmid pCas9101 was constructed with a tetracycline-inducible codon-optimized cas9 expression operon. Approximat...
【基金】 江苏省高等学校自然科学研究项目(16KJB180026)~~
【更新日期】 2019-01-15
【分类号】 R378
【正文快照】 结核病是高致死率感染性疾病,每年造成约200万人死亡[1-2]。研究结核分枝杆菌致病的分子机理是当前结核病防治研究的重要方向[3-4]。实验室培养结核分枝杆菌的倍增时间为24 h,对其操作需要专用设备且改造方法单一[5]。耻垢分枝杆菌是快速生长的非致病菌(倍增时间3-4 h),1885年?

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