草地贪夜蛾组织蛋白酶B的基因克隆、序列分析、三维结构预测及其分子对接模拟
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【英文篇名】
Gene Cloning,Sequence Analysis,and Three Dimensional Structure Prediction of Cathepsin B in Spodoptera frugiperda and Its Molecular Docking Simulation
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【作者】
程杏安 ;
叶静敏 ;
蒋旭红 ;
刘展眉 ;
胡美英 ;
【英文作者】
CHENG Xing-an ;
YE Jing-min ;
JIANG Xu-hong ;
LIU Zhan-mei ;
Hu Mei-ying ;
Institute of Natural Product Chemistry ;
Zhongkai University of Agriculture and Engineering ;
Laboratory of Insect Toxicology ;
South China Agricultural University ;
【作者单位】
仲恺农业工程学院天然产物化学研究所 ;
华南农业大学昆虫毒理研究室 ;
【文献出处】
生物技术通报
, Biotechnology Bulletin , 编辑部邮箱
2018年 01期
【中文关键词】
Sf9细胞 ;
Cathepsin B ;
基因克隆 ;
同源建模 ;
分子对接 ;
抑制剂 ;
【英文关键词】
Sf9 cell ;
Cathepsin B ;
gene cloning ;
homology modeling ;
molecular docking ;
inhibitor ;
【摘要】
昆虫组织蛋白酶B(Cathepsin B)在昆虫发育和代谢过程中发挥重要作用。本研究首先克隆了草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda(J.E.Smmith)的组织蛋白酶B基因Cathepsin B(SCB),获得其开放阅读框(ORF)序列(Gen Bank登录号:HQ110064)。生物信息学分析表明,该基因的开放阅读框包含1 026 bp的片段,编码341个氨基酸,预测N-末端含有长度为20个氨基酸残基的信号肽序列,去除信号肽序列后,预测成熟蛋白分子量为35.6 k D,等电点为6.59。氨基酸序列与15种物种Cathepsin B比较有51.2%-96.2%的一致性,与甜菜夜蛾Spodoptera exigua(Hiibner)相似度最高,达96.2%。利用同源建模预测SCB的三维结构,经动力学的优化,SCB折叠成紧密而稳定的球状结构,含6个对结构有稳定作用的二硫键,亲水性氨基酸主要包被在蛋白表面。同时分子对接模拟结果表明,SCB结合口袋比较浅,形状不规则,袋口较宽。ARG19、VAL23和ASN24为活性位点关键氨基酸残基,抑制剂CA与SCB活性位点3个关键氨基酸残基有较强的相互作用,且均...
【英文摘要】
Cathepsin B plays an important role in development and metabolism of insect.In present study,Cathepsin B(SCB)genewas cloned from Spodoptera frugiperda(J.E.Smmith)(Gen Bank accession number :HQ110064).Bioinformatics analysis showed that theopen reading frame(ORF)of SCB was 1 026 bp,encoding 341 amino acids,and the predicted N-terminus hydrophobic region contained 20 amino acid residues displaying the characteristic features of a signal peptide. The predicted molecular weight(MW)and isoelectric point(p I)of S...
【基金】
国家自然科学基金项目(21406274,21376281);
广东省大学生科技创新培育专项基金(攀登计划)(K1178350111);
广东省大学生创新训练项目(20171134701)
【更新日期】
2018-03-05
【分类号】
S433.4
【正文快照】
昆虫组织蛋白酶,尤其是Cathepsin B类酶,在不同物种中被研究,包括双翅目,鞘翅目,半翅目,鳞翅目等。在大多数鞘翅目昆虫中,组织蛋白酶B是肠内的一类蛋白水解酶,属于木瓜蛋白酶类[1]。大量的研究表明,组织蛋白酶与昆虫的消化作用、昆虫的个体发育、组织分化以及变态反应密切相关,
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