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基于G-SSR和EST-SSR标记的鲫6个群体遗传结构分析  
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【英文篇名】 GENETIC DIVERSITY AND STRUCTURE OF CRUCIAN CARP(CARASSIUS AURATUS) BASED ON G-SSR AND EST-SSR MARKERS
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【作者】 甘宝江; 庞美霞; 俞小牧; 童金苟;
【英文作者】 GAN Bao-Jiang; PANG Mei-Xia; YU Xiao-Mu; TONG Jin-Gou; State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology; Institute of Hydrobiology; Chinese Academy of Sciences; University of Chinese Academy of Sciences;
【作者单位】 中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室; 中国科学院大学;
【文献出处】 水生生物学报 , Acta Hydrobiologica Sinica, 编辑部邮箱 2018年 03期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 鲫; G-SSR; EST-SSR; 遗传多样性; 遗传结构;
【英文关键词】 Crucian carp(Carassius auratus); G-SSR; EST-SSR; Genetic diversity; Genetic structure;
【摘要】 研究同时利用非编码区和编码区微卫星标记(G-SSR和EST-SSR)分析黑龙江、长江、奉化江及淮河水系共6个野生鲫(Carassius auratus)群体的遗传多样性及遗传结构,并比较2类不同来源SSR用于鲫群体遗传多样性分析的差异。8个G-SSR标记在6个鲫群体中检测到173个等位基因,平均Na、Ne、Ho、He以及PIC分别为22、12.9、0.769、0.893和0.879,群体间Fst值介于0.008—0.085,其中来自黑龙江水系的2个群体与其余水系的所有群体均达到或接近于中等程度的遗传分化,而长江、奉化江和淮河水系4个群体间的遗传分化程度不明显。Nei’s遗传距离介于0.203—0.701;根据遗传距离所绘制的UPGMA聚类图将6个鲫群体划分为2个大分支,其中来自黑龙江水系的2个群体聚为一枝,其余水系群体聚为另一枝。贝叶斯分析也支持这一结果,将6个鲫群体划分为2个最佳理论群。利用8个EST-SSR标记在6个鲫群体中共检测到155个等位基因,平均Na、Ne、Ho、He以及PIC分别为19、9.5、0.728、0.870和0.855;群体间Fst值和Nei’s遗传距离分别介于0.005—0.084和...
【英文摘要】 This study investigated genetic diversity and genetic structure of six wild crucian carp populations collected from Heilongjiang River, Yangtze River, Fenghua River and Huaihe River by 8 genome microsatellites(G-SSR) and 8 transcriptome microsatellites(EST-SSR). The mean Na, Ne, Ho, He and PIC of the eight G-SSR loci were 22, 12.9,0.769, 0.893 and 0.879, respectively. Fst values ranged from 0.008 to 0.085, indicating that there were different degrees of genetic differentiation among the six wild crucian car...
【基金】 中国科学院先导专项A项目课题(XDA08010405-2); 淡水生态与生物技术国家重点实验室课题(2016FBZ05)资助~~
【更新日期】 2018-05-25
【分类号】 S917.4
【正文快照】 鲫属(Carassius)隶属鲤科(Cyprinidae)中的鲤亚科(Cyprininae),该属通常被划分为3个种:黑鲫(Carassius carassius)、鲫(Carassius auratus)和银鲫(Carassius auratus gibelio Bloch)。目前的研究表明,黑鲫主要分布于中欧、东欧,亚洲西伯利亚勒那河和我国新疆;鲫主要分布于中国?

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