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基于线粒体COⅠ的DNA条形码在对虾科种类鉴定中的研究  
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【英文篇名】 The research of COⅠ-based DNA barcoding in Penaeidaes' identification
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【作者】 易啸; 王攀攀; 王军; 苏永全; 毛勇;
【英文作者】 YI Xiao; WANG Panpan; WANG Jun; SU Yongquan; MAO Yong; State Key Laboratory of Marine Environmental Science; College of Ocean and Earth Sciences; Xiamen University;
【作者单位】 厦门大学海洋与地球学院近海海洋环境科学国家重点实验室;
【文献出处】 水产学报 , Journal of Fisheries of China, 编辑部邮箱 2018年 01期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 对虾科; DNA条形码; COⅠ基因; 鉴别;
【英文关键词】 Penaeidaes; DNA barcoding; COⅠ gene; identification;
【摘要】 对虾科包含有26个属,约有200多种对虾,由于同属内的对虾在形态上非常相似,只呈现细微的差别,因此使得只基于形态学对对虾科物种的鉴别非常困难。为确定DNA条形码技术在对虾科物种鉴别的可行性,本研究中,采用线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因研究了32种对虾的核苷酸组成、对虾种间及种内遗传距离,用邻接法构建32种对虾COⅠ基因序列系统发生树。结果显示,对虾COⅠ基因组成偏倚明显,A+T含量(61.5%)显著高于G+C(38.5%)。基于Kimura双参数模型计算,32个物种的种内平均遗传距离为0.003,种间平均遗传距离(0.468)是种内遗传距离的156倍,符合Hebert提出的种间遗传距离大于或等于10倍种内遗传距离的标准。在系统进化树中,32种对虾中有30种对虾都以较高的置信度聚合成独立的分支。可见,线粒体COⅠ基因作为对虾科DNA条形码在物种的鉴别上具有很好的应用性,可以作为形态学分类系统的必要补充和佐证。
【英文摘要】 The Penaeidae comprises 26 genera and approximately 200 species as most of Penaeidae shrimps in the same genus are morphologically similar, and just exhibited subtle morphological differences, which makes identification of Penaeidae shrimps a difficult task based on taxonomic keys alone. In order to define the practicability of DNA barcoding in identification of Penaeidae shrimps, in this study, we used COⅠ gene to examine 32 kinds of Penaeidaes' nucleotide composition, interspecific genetic distance and in...
【基金】 国家虾产业技术体系专项(CARS-48); 福建省科技厅重大专项(2016NZ0001-4); 厦门海洋经济创新发展示范项目(16CZY009SF05)~~
【更新日期】 2018-01-17
【分类号】 S917.4
【正文快照】 DNA条形码技术是一种利用一小段DNA序列来识别物种和发现新物种的有效工具[1-3]。但是,随着这项技术的使用,DNA条形码技术也引起了较多的争议,并且它本身的一些缺陷也逐渐被发现[4-5]。尽管如此,DNA条形码技术仍可有效地应用于鉴别和发现物种[6]、探究物种多样性[7]、鉴别亲缘?

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