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PCR反应程序对土壤微生物PCR-DGGE分析的影响  
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【英文篇名】 Effect of PCR procedures on PCR-DGGE analysis of soil microbial community
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【作者】 武丽娟; 陈月星; 刘小凤; 宋月; 张战凤; 樊永亮;
【英文作者】 Wu Lijuan;
【作者单位】 西北农林科技大学植物保护学院; 西北农林科技大学农学院;
【文献出处】 江苏农业科学 , Jiangsu Agricultural Sciences, 编辑部邮箱 2018年 21期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 土壤微生物; 群落结构; 种群多样性; PCR-DGGE; PCR反应程序;
【摘要】 利用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)探讨不同PCR反应程序(降落式PCR、巢式-降落式PCR、普通PCR、巢式PCR)对土壤微生物PCR-DGGE群落结构和种群多样性分析的影响。利用Quantity One4. 6. 2软件对DGGE指纹图谱进行数字化处理,并计算相应PCR程序下DGGE图谱的多样性指数、丰富度指数、均匀度指数和不同反应程序下图谱的戴斯系数,应用SPSS 16. 0软件对相关指数进行方差分析,检测不同反应程序间各指数的差异显著性。不同PCR反应程序在土壤微生物PCR-DGGE分析时,其群落结构和种群多样性指数间存在明显差异。单纯应用降落式PCR虽然提高了扩增的特异性,却降低了扩增效率,其DGGE图谱丰富度较低,多样性较差,与其他反应程序的DGGE图谱相似度较低;普通PCR反应的DGGE图谱多样性和丰富度较高,与2种巢式PCR相似,然而由于普通PCR在复杂模板情况下容易发生错配,难以保证扩增特异性,因而夸大样品中微生物种群多样性,与2种巢式PCR的DGGE图谱相似度较低。2种巢式PCR反应程序下的DGGE图谱条带丰富,多样性高,群落结构相似度高,能比较全面和科学地反映样品中微...
【基金】 国家自然科学基金(编号:31772533)
【更新日期】 2018-12-29
【分类号】 S154.3
【正文快照】 土壤微生物是陆地生态系统中重要的组成部分,积极参与土壤养分循环、有机质分解及肥力形成等重要的生态过程[1]。它们的生存很容易受到很多环境因子的影响,如污染物、地表植被、土地利用方式、土壤类型等,因此常常被认为是土壤生态系统变化的指示者。除了对与土壤微生物密切相?

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