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一个跖骨短小症家系全基因组测序研究

Whole genome sequencing in a family with metatarsal shortness

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【作者】 邓阳龚弘强李宝华侯海峰焦凤萍李群伟

【Author】 DENG Yang;GONG Hong-qiang;LI Bao-hua;HOU Hai-feng;JIAO Feng-ping;LI Qun-wei;

【通讯作者】 李群伟;

【机构】 泰山医学院流行病学研究所西藏自治区疾病预防控制中心地方病防治研究所

【摘要】 目的对一个跖骨短小症家系的成员进行全基因组测序,探究其可能的致病因素。方法应用Illumina Hi Seq X ten测序平台对一个跖骨短小症家系中2例病例和3例正常人进行测序,测序数据经过1 000 Genomes Project和db SNP数据库过滤,筛选出突变基因。结果跖骨短小症呈X染色体隐性遗传。在X染色体上得到1 527个特异性单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)。没有筛选到符合条件的特异性小片段的插入/缺失(insertion/deletion,In/del)。经过1 000 Genomes Project和db SNP数据库比对后,得到位于11个基因上的39个特异性SNP位点,包括CCNB3、CYSLTR1、GK、NR0B1、PCYT1B、PRPS2、SHROOM4、SMS、TBL1X、TLR7、TLR8基因。结论这些基因SNP位点在我国汉族人群中也是存在的,提示本家系疾病并非单纯由遗传因素导致。

【基金】 国家自然科学基金课题(81060228,81273155);山东省自然科学基金课题(ZR2012HL47)
  • 【文献出处】 中华疾病控制杂志 ,Chinese Journal of Disease Control & Prevention , 编辑部邮箱 ,2018年10期
  • 【分类号】R596;R440
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