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一个跖骨短小症家系全基因组测序研究
Whole genome sequencing in a family with metatarsal shortness
【摘要】 目的对一个跖骨短小症家系的成员进行全基因组测序,探究其可能的致病因素。方法应用Illumina Hi Seq X ten测序平台对一个跖骨短小症家系中2例病例和3例正常人进行测序,测序数据经过1 000 Genomes Project和db SNP数据库过滤,筛选出突变基因。结果跖骨短小症呈X染色体隐性遗传。在X染色体上得到1 527个特异性单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)。没有筛选到符合条件的特异性小片段的插入/缺失(insertion/deletion,In/del)。经过1 000 Genomes Project和db SNP数据库比对后,得到位于11个基因上的39个特异性SNP位点,包括CCNB3、CYSLTR1、GK、NR0B1、PCYT1B、PRPS2、SHROOM4、SMS、TBL1X、TLR7、TLR8基因。结论这些基因SNP位点在我国汉族人群中也是存在的,提示本家系疾病并非单纯由遗传因素导致。
【基金】 国家自然科学基金课题(81060228,81273155);山东省自然科学基金课题(ZR2012HL47)
- 【文献出处】 中华疾病控制杂志 ,Chinese Journal of Disease Control & Prevention , 编辑部邮箱 ,2018年10期
- 【分类号】R596;R440
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