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干旱处理下2个梨品种转录组差异表达基因分析  
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【英文篇名】 Analysis of differentially expressed genes in transcriptomes of two pear genotypes under drought stress
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【作者】 王华; 汪王微; 刘春旖; 王巧巧; 朱立武; 徐小牛;
【英文作者】 WANG Hua; WANG Wangwei; LIU Chunyi; WANG Qiaoqiao; ZHU Liwu; XU Xiaoniu; Key Laboratory of Pomology; Anhui Agricultural University; School of Forestry and Landscape Architecture;
【作者单位】 安徽农业大学果树学重点实验室; 安徽农业大学林学与园林学院;
【文献出处】 华南农业大学学报 , Journal of South China Agricultural University, 编辑部邮箱 2018年 04期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 ; 干旱; 转录组; 差异表达基因; 代谢通路; 转录因子;
【英文关键词】 pear; drought; transcriptome; differentially expressed gene; metabolic pathway; transcription factor;
【摘要】 【目的】以转录组数据为基础挖掘梨抗旱关键基因,为培育梨抗旱品种提供理论基础。【方法】以正常浇水和干旱处理下黄冠梨Pyrus bretschneideri‘Xuehuali’×P.pyrifolia‘Shinsseiki’和黄金梨P.pyrifolia‘Niitaka’×P.pyrifolia‘Nijisseiki’的叶片进行Illumina Hi Seq TM 2000高通量转录组测序分析,利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库分析2个梨品种中的差异表达基因(DEGs)。【结果】2个梨品种间在正常浇水和干旱处理下分别发现了4 377和3 841个DEGs,其中只在干旱处理下的DEGs有1 340个。这些DEGs在GO数据库的3个本体生物过程、分子功能和细胞成分中富集到的数量分别是1 387、922和1 253个,与植物抗旱相关的代谢过程、应激反应和生物膜等条目分别富集到349、139和151个DEGs。仅在干旱处理下的1 340个DEGs被比对到102个KEGG代谢通路上,其中与植物内源激素相关的代谢通路有3个。将1 340个DEGs进行转录因子分析发现,被注释为转录因子的有37个,...
【英文摘要】 【Object】To discover key genes related to drought resistance of pear plants based on transcriptome data, and provide a theoretical foundation for the breeding of drought resistant pear varieties.【Method】High through-put transcriptome sequencing by illumina Hi Seq TM 2000 was performed using leaves of ‘Huangguan'pear(Pyrus bretschneideri ‘Xuehuali'×P. pyrifolia ‘Shinsseiki') and ‘Hwangkumbae' pear(P. pyrifolia‘Niitaka'×P. pyrifolia ‘Nijisseiki') under normal irrigation and drought stress treatments. Gene onto...
【基金】 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-29-14); 安徽省高校自然科学研究项目(KJ2016A237,KJ2016A558)
【更新日期】 2018-08-03
【分类号】 S423;S661.2
【正文快照】 网络首发地址:http://kns.cnki.net/kcms/detail/44.1110.S.20180611.1417.026.html随着全球气候变暖,干旱发生更加频繁,持续时间更长,平均气温和极端气温都有所上升[1]。同时,其他非生物胁迫也会导致植物脱水,如冻害、干热风及盐胁迫等。当受到干旱胁迫时,植物会调动多水平的?

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