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几种北极桧叶螅和薮枝螅的DNA条形码分析

DNA Barcoding of Several Species of Sertularia and Obeliain Arctic

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【作者】 赵霞张培玉刘晨临林学政

【Author】 ZHAO Xia;ZHANG Pei-yu;LIU Chen-lin;LIN Xue-zheng;College of Enviromental Science and Engineering,Qingdao University;The First Institute of Oceanography,SOA;Key Laboratory of Marine Bioactive Substances,SOA;

【机构】 青岛大学环境科学与工程学院国家海洋局第一海洋研究所海洋生物活性物质国家海洋局重点实验室

【摘要】 以2016年第7次北极科学考察期间在不同海域采集到的形态各异的水螅样品为研究对象,初步描述了样品的形态特征,并且利用DNA条形码序列进行了分子鉴定。基于16SrRNA基因序列构建的系统进化树表明,S12,NB06,R01和NB05属于桧叶螅科桧叶螅属,R08和B08为钟形螅科薮枝螅属,而且不同种的水螅均以较高的置信度聚类为一个稳定的分支。因此16SrRNA序列可以作为DNA条形码用于这2属的水螅的分类鉴定。桧叶螅的COI序列扩增较困难,不宜作为DNA条形码用于该属的鉴定,而薮枝螅的COI序列则较易扩增。基于16S rRNA和COI序列的长薮枝螅种间遗传距离均远大于种内遗传距离,存在明显的条形码间隙。且薮枝螅基于COI序列的种内遗传距离比16SrRNA基因的更大,认为COI序列可作为薮枝螅不同地理起源的分析鉴定依据。

【Abstract】 In this paper,six hydroids collected from different stations in the Seventh Chinese Arctic Scientific Expedition in 2016,were classified by DNA barcoding.And some general features were described.Phylogenetic trees of the mitochondrial 16 SrRNA genes revealed that S12,NB06,R01 and NB05 are assigned to Sertularia(Sertulariidae),R08 and B08 are Obelia(Campanulariidae).Moreover,specific species of hydroids are clustered into one stable clade supported by high bootstrap values.Hence,16 SrRNA gene can be used as a DNA barcode to identify the two genera.The COI gene is unsuitable as a DNA barcode because it is hard to be amplified in Sertularia.While for Obelia,the COI genes are easy to be amplified.The intraspecific genetic distance is far larger than the Interspecific genetic distance based on the two genes of Obelia longissima,and the Interspecific based on COI genes is larger than on 16 SrRNA sequences.Therefore the COI sequence appears to be an effective marker in the identification of different geographical origin strains for Obelia.

【关键词】 DNA条形码北极水螅桧叶螅薮枝螅
【Key words】 DNA barcodingArctic hydroidsSertulariaObelia
【基金】 南北极环境综合考察与评估专项——北极生物生态考察(CHINARE2017-03-05)
  • 【文献出处】 海洋科学进展 ,Advances in Marine Science , 编辑部邮箱 ,2018年02期
  • 【分类号】Q953
  • 【被引频次】2
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