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杜仲EuDREB1基因的克隆及生物信息学分析  
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【英文篇名】 Cloning and Bioinformatics Analysis of EuERDB1 Gene from Eucommia ulmoides Oliv.
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【作者】 杨玲玲; 王磊; 赵德刚; 赵懿琛;
【英文作者】 Yang Lingling; Wang Lei; Zhao Degang; Zhao Yichen; The Key Laboratory of Plant Resources Conservation and Germplasm Innovation in Mountainous Region (Ministry of Education); Guizhou Key Laboratory of Agro-Bioengineering; Institute of Agro-Bioengineering and College of Life Sciences; Guizhou University; The 2011 Collaboration Innovation Center for Mountain Ecology and Agro-Bioengineering in Guizhou Province; Guizhou Academy of Agricultural Sciences; College of Tea Sciences;
【作者单位】 贵州大学生命科学学院农业生物工程研究院贵州省农业生物工程重点实验室山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室; 贵州省山地生态与农业生物工程2011协同创新中心; 贵州省农业科学院; 贵州大学茶学院;
【文献出处】 分子植物育种 , Molecular Plant Breeding, 编辑部邮箱 2018年 21期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 杜仲; EREBP基因家族; EuERDB1; 基因克隆; 生物信息学分析;
【英文关键词】 Eucommia ulmoides; EREBP gene family; Eu DREB1; Gene cloning; Bioinformatics analysis;
【摘要】 本研究在课题组已构建的杜仲基因组数据库注释的信息基础上设计特异性引物,利用同源克隆的方法从杜仲转录本中克隆得到一个基因的全长编码序列(CDS),将该基因命名为EuDREB1。序列分析结果表明EuDREB1基因的CDS序列全长为255 bp,共编码84个氨基酸,包含1个AP2结构域,且该结构域的第14位氨基酸为缬氨酸(V),符合DREB类转录因子的蛋白序列特征,推断EuDREB1基因属于该类转录因子基因。分析可知,转录因子EuDREB1为不稳定的亲水性蛋白,相对分子质量为9.41 kD,理论等电点pI为5.66,含有磷酸化位点但不具有信号肽及跨膜结构;其二级结构中含有4个α-螺旋、1个β-折叠及6个无规卷曲;其三级结构以α螺旋及β折叠为主,符合AP2结构域的模型特征。本研究通过克隆EuDREB1基因并进行相应的生物信息学分析,为进一步探明杜仲DREB转录因子相关基因的功能提供了一定的实验基础。
【英文摘要】 In this study, the specific primers were designed based on the annotated information of the genome database of Eucommia ulmoides, which had been constructed by the research group. A full-length coding sequence(CDS) of a gene was cloned from Eucommia ulmoides transcript by homologous cloning, and the gene was named as EuDREB1. Sequence analysis showed that the CDS of Eu DREB1 was 255 bp, encoding 84 amino acids. Also, it contained a AP2 conserved domain, and the 14 thamino acid of this domain was valine(V), ...
【基金】 国家863计划(2013AA102605); 国家自然科学基金(31660076); 贵州省科学技术基金(黔科合J字[2015]2042号)共同资助
【更新日期】 2018-12-07
【分类号】 Q943.2;S567.19
【正文快照】 阳, 550006*同等贡献作者Cloning and Bioinformatics Analysis of EuERDB1 Gene from Eucommiaulmoides Oliv.Yang Lingling1,2*Wang Lei1,2*Zhao Degang1,2,4**Zhao Yichen1,2,3**1 The Key Laboratory of Plant Resources Conservation and Germplasm Innovation in Mountai

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