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甘蓝型油菜种子发育灌浆后期的转录组分析  
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【英文篇名】 Transcriptome Analysis of Seed Development of Brassica napus in Later Filling Stage
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【作者】 熊辉岩; 段瑞君; 王瑞生; 孟庆志;
【英文作者】 Xiong Huiyan; Duan Ruijun; Wang Ruisheng; Meng Qingzhi; College of Agriculture and Animal Husbandry; Qinghai University; Key Labratory of Spring Rape Genetic Improvement of Qinghai Province; Academy of Agriculture and Forestry Science; College of Eco-environmental Engineering;
【作者单位】 青海大学农牧学院; 青海省农林科学院春油菜遗传改良重点实验室; 青海大学生态环境工程学院;
【文献出处】 分子植物育种 , Molecular Plant Breeding, 编辑部邮箱 2018年 15期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 甘蓝型油菜; 种子; 灌浆后期; 转录组;
【英文关键词】 Brassica napus; Seed; Late filling stage; Transcriptome;
【摘要】 油菜种子发育是产量和品质形成的关键发育阶段,包含了复杂的发育过程和调控网络,有效地解析种子发育的转录调控机制具有重要的意义。以甘蓝型春油菜品种青杂5号为研究材料,利用RNA-seq技术对种子发育的后期(30-DAF,40-DAF)2个发育时间进行转录组测序,筛选差异基因,并利用GO数据库和KEGG数据库注释差异基因功能和可能参与的调控途径。结果表明,从油菜种子灌浆后期的2个时间点的转录组中分别检测到70 850和65 193个表达基因,筛选得到2 654个差异表达基因,其中1 941个基因下调表达,713个基因上调表达,29个基因表达差异倍数|log2Ratio|≥10。GO基因功能分析显示,生物学途径中富集最显著的条目是染色质组装相关的等生物学过程,分子功能方面富集最显著的条目依次是蛋白质代谢、营养库活性等功能类别,而在细胞组件方面富集最显著的条目是染色体相关的等细胞组件。Pathway显著性富集分析显示注释基因最多的途径是次生代谢途径,其次是淀粉、蔗糖代谢途径、苯丙素生物合成途径中的、碳代谢途径和氨基酸生物合成途径。甘蓝型油菜种子发育后期的转录组分析表明,种子发育30-DAF时期次生代谢物、脂质代谢等表达...
【英文摘要】 Seed development is the key developmental stage in the formation of yield and quality in rape. It contains complex developmental process and regulatory network. It is also important to analyze the transcriptional regulation mechanism of seed development effectively. Two development times(30-DAF, 40-DAF) in later filling stage of seed growth were sequenced in transcriptome using the technology of RNA-seq by taking Brassica napus spring variety Qingza 5 as test materials. Differentially expressed genes were s...
【基金】 青海省科技厅应用基础研究计划项目(2015-ZJ-707)资助
【更新日期】 2018-08-23
【分类号】 S565.4
【正文快照】 810016Transcriptome Analysis of Seed Development of Brassica napus in LaterFilling StageXiong Huiyan 1,2*Duan Ruijun 3 Wang Ruisheng 2 Meng Qingzhi 11 College of Agriculture and Animal Husbandry,Qinghai University,Xining,810016;2 Key Labratory of Spring R

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