中国学术期刊网络出版总库
  关闭
一种基于图塌缩的药物分子检索方法  
   推荐 CAJ下载 PDF下载
【英文篇名】 A retrieval method of drug molecules based on graph collapsing
【下载频次】 ★☆
【作者】 瞿经纬; 吕肖庆; 刘振明; 廖媛; 孙鹏晖; 王蓓; 汤帜;
【英文作者】 QU Jing-wei; LV Xiao-qing; LIU Zhen-ming; LIAO Yuan; SUN Peng-hui; WANG Bei; TANG Zhi; Institute of Computer Science & Technology; Peking University; State Key Laboratory of Digital Publishing Technology; Department of Medical Chemistry; Peking University School of Pharmaceutical Sciences;
【作者单位】 北京大学计算机科学技术研究所; 数字出版技术国家重点实验室; 北京大学药学院药物化学系;
【文献出处】 北京大学学报(医学版) , Journal of Peking University(Health Sciences), 编辑部邮箱 2018年 02期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 信息存储和检索; 分子结构; 图结构; 超图; 算法;
【英文关键词】 Information storage and retrieval; Molecular structure; Graph structure; Hypergraph; Algorithms;
【摘要】 目的:为实现准确、高效的医药信息查询,本文探索了一种基于图结构的药物分子检索方法。方法:基于图结构的药物分子检索方法以接收智能终端的拍照或手绘作为输入,并将输入的结构式形式化为相应图结构,基于对图匹配效率的直接影响因素的分析,建立了结构式的一种紧凑有效的超图表示形式,其依据结构式的特点结合了子图匹配与频繁子图挖掘等方法对大图进行多级塌缩。为避免塌缩过程中子图交叠问题阻碍超图的准确构建,引入一种基于图同构的算法,借助子图之间交叠情况的分析,选择占优子图,利用多维度信息完成精确的分子匹配。结果:为证明检索方法的有效性,将本文检索方法和Wikipedia Chemical Structure Explorer(WCSE)进行检索准确率的对比,结果表明,本文方法的检索准确率更高,前10个检索结果的MAP(mean average precision)、DCG(discounted cumulative gain)、RBP(rank-biased precision)和ERR(expected reciprocal rank)四个指标均高于WCSE。上述指标的领先幅度分别为10%、1.41、6.42%、1.32%。进一...
【英文摘要】 Objective: To establish a compact and efficient hypergraph representation and a graphsimilarity-based retrieval method of molecules to achieve effective and efficient medicine information retrieval. Methods: Chemical structural formula( CSF) was a primary search target as a unique and precise identifier for each compound at the molecular level in the research field of medicine information retrieval. To retrieve medicine information effectively and efficiently,a complete workflow of the graphbased CSF retrie...
【基金】 国家自然科学基金(61573028、61673029); 新闻出版业科技与标准重点实验室(新闻出版智能媒体技术重点实验室); 北京大学医学-信息科学交叉学科种子基金项目(BMU20160579)资助~~
【更新日期】 2018-05-07
【分类号】 R-05
【正文快照】 大学药学院药物化学系,北京100191)△Corresponding author’s e-mail,lvxiaoqing@pku.edu.cn网络出版时间:2018-3-6 15:50:32网络出版地址:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.4691.R.20180306.1550.020.html医药信息检索旨在服务于大型的医药数据库、信息库和知识库,需要融?

xxx
【读者推荐文章】中国期刊全文数据库
【相似文献】
中国期刊全文数据库
中国优秀硕士学位论文全文数据库
中国博士学位论文全文数据库
中国重要会议论文全文数据库
中国重要报纸全文数据库
中国学术期刊网络出版总库
点击下列相关研究机构和相关文献作者,可以直接查到这些机构和作者被《中国知识资源总库》收录的其它文献,使您全面了解该机构和该作者的研究动态和历史。
【文献分类导航】从导航的最底层可以看到与本文研究领域相同的文献,从上层导航可以浏览更多相关领域的文献。

医药、卫生
  一般理论
   医学与其他学科的关系
  
 
  CNKI系列数据库编辑出版及版权所有:中国学术期刊(光盘版)电子杂志社
中国知网技术服务及网站系统软件版权所有:清华同方知网(北京)技术有限公司
其它数据库版权所有:各数据库编辑出版单位(见各库版权信息)
京ICP证040431号    互联网出版许可证 新出网证(京)字008号