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陆地棉ARF与LAV家族成员鉴定及表达模式分析  
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【英文篇名】 Identification and expression pattern analysis of ARF and LAV family members of upland cotton(Gossypium hirsutum)
【下载频次】 ★★★★
【作者】 孙旭; 苏雪强; 樊洪泓; 郭宁; 高俊山; 蔡永萍; 林毅;
【英文作者】 SUN Xu; SU Xueqiang; FAN Honghong; GUO Ning; GAO Junshan; CAI Yongping; LIN Yi; School of Life Science; Anhui Agricultural University;
【作者单位】 安徽农业大学生命科学学院;
【文献出处】 安徽农业大学学报 , Journal of Anhui Agricultural University, 编辑部邮箱 2018年 02期  
期刊荣誉：ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 陆地棉; B3超家族; ARF和LAV家族; 生物信息学; 表达模式;
【英文关键词】 upland cotton; B3 superfamily; ARF and LAV; bioinformatics; expression pattern;
【摘要】 为了了解B3超家族在棉花纤维发育及色素代谢过程中的作用,应用生物信息学的方法,对陆地棉B3超家族中的ARF和LAV亚族成员的序列特征、染色体定位、保守基序、基因结构、系统进化以及表达模式进行分析。结果表明,在陆地棉基因组中鉴定出49个GhARF和8个GhLAV,通过表达模式分析表明,GhARF17、GhARF18、GhARF20、GhARF21、GhARF43、GhARF44、GhARF45、GhARF47、GhARF49以及GhLAV1、GhLAV3和GhLAV6在纤维不同发育时期的表达模式和纤维中原花青素含量变化趋势相符,推测可能参与纤维成色过程。
【英文摘要】 To understand the role of B3 superfamily in the process of upland cotton fiber development and pigment metabolism by using bioinformatics methods, ARF and LAV subfamily members of the B3 superfamily in upland cotton were characterized by sequence, chromosome location, conserved motifs, gene structure, phylogenetic evolution, and expression patterns. The results showed that ARF and LAV subfamily members of the B3 superfamily in upland cotton were screened and identified 49 GhARF and 8 GhLAV in the genome of ...
【基金】 安徽省高校自然科学基金(KJ2016A840和KJ2014A078); 安徽省棉花产业技术体系共同资助
【更新日期】 2018-06-07
【分类号】 S562
【正文快照】 B3超家族是植物特有的一种转录因子,在植物生长发育过程中起到至关重要的作用,植物基因组中大多都含有B3超家族。前人对拟南芥和水稻的研究发现[1],B3超家族成员分别有118个和91个,在其他植物中也有发现,如藻类,苔藓植物和裸子植物。B3超家族可分为LAV(LEAFYCOTYLEDON2[LEC2]-A

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