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一段检测锥虫特异性核酸靶序列的筛选及评价  
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【英文篇名】 Screening and evaluation of a specific nucleic acid target sequence for detection of trypanosome
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【作者】 洪清华; 王韵丞; 李鸿雁; 张瑞祥; 李健; 陈木新; 刘骁; 殷明波; 王敬文; 胡薇;
【英文作者】 HONG Qing-hua; WANG Yun-cheng; LI Hong-yan; ZHANG Rui-xiang; LI Jian; CHEN Mu-xin; LIU Xiao; YIN Ming-bo; WANG Jing-wen; HU Wei; School of Life Science; Fudan University; National Institute of Parasitic Diseases; Chinese Center for Disease Control and Prevention; WHO Collaborating Centre for Tropical Diseases; National Center for International Research on Tropical Diseases; Ministry of Science and Technology; Key Laboratory of Parasite and Vector Biology; Ministry of Health; Jin Fu Kang Biotechnology (Limited) Company;
【作者单位】 复旦大学生命科学学院; 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所世界卫生组织热带病合作中心科技部国家级热带病国际联合研究中心卫生部寄生虫病原与媒介生物学重点实验室; 金弗康生物科技(有限)公司;
【文献出处】 中国寄生虫学与寄生虫病杂志 , Chinese Journal of Parasitology and Parasitic Diseases, 编辑部邮箱 2017年 06期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 锥虫属; 序列比对; PCR检测; 靶序列;
【英文关键词】 Trypanosoma; Sequences alignment; PCR detection; Target sequence;
【摘要】 目的以60S核糖体蛋白L44(60S RPL44)基因为靶基因,筛选出一段可特异性检测锥虫属(Trypanosoma)原虫的核酸靶序列,并对其敏感度和特异性进行初步评价。方法将布氏锥虫指名亚种(T.brucei brucei)的60S RPL44基因序列与公共数据库中田鼠巴贝虫(Babesia microti)、杜氏利什曼原虫(Leishmania donovani)、间日疟原虫(Plasmodium vivax)、恶性疟原虫(P.falciparum)和刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)等24种非锥虫属常见的血源性原虫,以及8种锥虫属内其他种的同源序列进行比对。同时,利用Primer Premier 6对布氏锥虫指名亚种的60S RPL44基因序列设计多对引物,结合序列比对结果和各引物评价情况,从中筛选出一对评价情况良好且理论上仅能扩增锥虫属靶序列的引物。利用该对引物检测布氏锥虫指名亚种、布氏锥虫罗德西亚种(T.b.rhodesiense)、刚果锥虫(T.congolense)、伊氏锥虫(T.evansi)以及上述5种其他属原虫,评价其特异性。采用梯度稀释(10 ng/μl、1 ng/μl、1...
【英文摘要】 Objective To screen and identify a specific nucleic acid target sequence for detecting Trypanosoma based on 60 S ribosomal protein L44(60 S RPL44) gene sequence of Trypanosoma brucei brucei, and evaluate its sensitivity and specificity. Methods The 60 S RPL44 sequence of T. b. brucei was blasted with its homologous sequences from Babesia microti, Leishmania donovani, Plasmodium vivax, P. falciparum, Toxoplasma gondii, as well as the other genera of protozoan and trypanosome species, on a public database. Me...
【基金】 闵行区产学研合作计划项目(No.2014MH113); 国家寄生虫种质资源共享服务平台(平台-TDRC-22)~~
【更新日期】 2018-01-17
【分类号】 R382.23
【正文快照】 [1 School of Life Science,Fudan University,Shanghai 200438,China;2 National Institute of ParasiticDiseases,Chinese Center for Disease Control and Prevention;WHO Collaborating Centre for TropicalDiseases;National Center for International Research on Tropic

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