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RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因预测  
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【英文篇名】 Prediction of the target genes mediated by RYBP in the leukemic cell apoptosis
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【作者】 李秋兰; 王顺清; 张玉平; 陈晓燕; 谢健晋; 吴亮亮;
【英文作者】 LI Qiulan; WANG Shunqing; ZHANG Yuping; CHEN Xiaoyan; XIE Jianjin; WU Liangliang; Department of Hematology; Guangzhou First People′s Hospital; Guangzhou Medical University;
【作者单位】 广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科;
【文献出处】 实用医学杂志 , The Journal of Practical Medicine, 编辑部邮箱 2017年 16期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 RYBP; 白血病; 二代测序; 靶基因;
【英文关键词】 RYBP; second-generation sequencing; target gene;
【摘要】 目的探讨RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因。方法利用慢病毒介导的RNA干扰技术,建立多批次RYBP基因稳定沉默的HL60细胞株及空载体对照组(NC);通过二代测序技术对不同批次干扰的上述3对细胞进行mRNA测序及miRNA测序,利用KEGG等生物信息学分析方法 ,预测靶基因。结果成功构建RYBP稳定沉默的HL60细胞株。二代测序筛选出明显差异的mRNA及miRNA(P<0.05)。Pathway显著性富集分析发现表达下调的基因与氨基酸合成,癌症转录调节紊乱,氨基酸代谢等相关的KEGG pathway有关,详见后述;沉默RYBP后,SPI1与hsa-miR-214-3p均表达降低(P<0.05)。结论RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因可能为:BBC3、BAI1、SESN2、CCNG2、JAK3、STAT4、SPI1、BCL6、CD11b和hsa-miR-214-3p。
【英文摘要】 Objective To investigate the target genes in RYBP-mediated leukemia cell apoptosis by highflux sequencing.Methods The HL-60 cell line with knockdown of RYBP was set up.MRNA and microRNA sequencing was conducted by the next-generation sequencing technology.Result MRNAs and miRNAs were dysregulated in HL-60 cell line with knockdown of RYBP.The results of KEGG analysis indicated that the down-regulated genes were associated with cancer transcription regulation and amino acid metabolism.SPI1 and miR-214-3p were...
【基金】 广东省自然科学基金(编号:2014A030313676); 中华医学会临床医学科研专项资金(编号:16010050621); 广州市科技计划项目(编号:201508020254)
【更新日期】 2017-08-29
【分类号】 R733.7
【正文快照】 在我国,白血病是十大高发恶性肿瘤之一,其发生率及复发率仍不断上升。但是,白血病的病因和发病机制尚未完全清楚,具有遗传学、分子生物学或者免疫学特异性标志的患者不到50%,而非靶向药物治疗引起化疗耐受增加及化疗后细胞毒副作用增大。因此,某些新的与疾病发生、进展有关的特

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