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吉林省2011年手足口病死亡病例肠道病毒71型分离株全基因组基因特征分析  
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【英文篇名】 Analysis of genetic characteristics of whole genome of enterovirus 71 strain isolated from patients who died from hand, foot and mouth disease in Jilin Province in 2011
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【作者】 魏雷雷; 周剑惠; 黄飚; 邓立权; 王爽; 李可维; 单元春; 杨尧; 曹凤瑞; 程涛; 付思美;
【英文作者】 WEI Lei-lei; ZHOU Jian-hui; HUANG Biao; DENG Li-quan; WANG Shuang; LI Ke-wei; SHAN Yuan-chun; YANG Yao; CAO Feng-rui; CHENG Tao; FU Si-mei; Jilin Provincial Center for Health Surveillance and Test;
【作者单位】 吉林省卫生监测检验中心病毒所; 吉林省疾病预防控制中心免疫规划所;
【文献出处】 中国生物制品学杂志 , Chinese Journal of Biologicals, 编辑部邮箱 2017年 11期  
期刊荣誉：ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 手足口病; 肠道病毒71型; 全基因组;
【英文关键词】 Hand; foot and mouth disease(HFMD); Enterovirus 71(EV71); Whole genome;
【摘要】 目的分析吉林省2011年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)死亡病例标本中分离获得的肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)毒株全基因组基因特征。方法采用分段RT-PCR法对2011年吉林省HFMD死亡病例EV71分离株JL2011-56全基因组进行扩增和测序。利用Clustal X2和MEGA5软件构建分离株JL2011-56与Gen Bank中27株参考株的全基因组序列和VP1区全基因组序列的进化树,分析Jl2011-56株的流行病学特征;同时与Gen Bank中12株C4a基因亚型参考株进行全基因组核苷酸和氨基酸序列的同源性分析。结果 JL2011-56分离株属于C4a亚型,核苷酸序列和氨基酸序列与山东分离株SDLY107(JX244186.1)同源性最高,分别为99.2%和99.5%,与EV71原型株Br Cr的同源性分别为79.9%和95.7%。结论 JL2011-56分离株与山东株亲缘关系较近,可能存在共同的与中枢神经毒力相关的氨基酸突变位点。
【英文摘要】 Objective To analyze the genetic characteristics of whole genome of enterovirus 71(EV71) isolated from patients who died from hand, foot and mouth disease(HFMD)in Jilin Province in 2011. Methods The whole genome of EV71 JL2011-56 strain isolated from the patients who died from HFMD in Jilin Province in 2011 was amplified and sequenced by segmented RT-PCR. Phylogenetic tree was constructed based on the whole genome sequences and genome sequences of VP regions of JL2011-56 strain and 27 reference strains in G...
【基金】 吉林省人社厅2010年度留学回国人员科技创新创业项目(2010-27); 国家科学技术艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项传染病监测技术平台项目(2012ZX10004209-003)
【更新日期】 2017-11-28
【分类号】 R725.1
【正文快照】 肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)属小RNA病毒科肠道病毒属,其基因组为单股正链RNA,长约7 400 bp,仅有1个ORF,编码1个多聚蛋白,该多聚蛋白可水解为4种结构蛋白(VP1~VP4)和7种非结构蛋白(2A~2C及3A~3D)[1]。在ORF两端还各有1段保守的非编码区(un-translatedregion,UTR),3′-末

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