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基于转录组测序的哈萨克绵羊感染包虫病后小肠组织新转录本预测及分析  
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【英文篇名】 Prediction and analysis of novel transcripts based on RNA-seq of Kazakh Sheep infected by Echinococcosis
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【作者】 李鑫; 贾李佳; 徐路路; 王悦; 蒋松; 王开胜; 席继峰; 贾斌;
【英文作者】 Li Xin; Jia Lijia; Xu Lulu; Wang Yue; Jiang Song; Wang Kaisheng; Xi Jifeng; Jia Bin; College of Life Science; Shihezi University; College of Animal Science and Technology;
【作者单位】 石河子大学生命科学学院; 石河子大学动物科技学院;
【文献出处】 石河子大学学报(自然科学版) , Journal of Shihezi University(Natural Science), 编辑部邮箱 2017年 03期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 哈萨克绵羊; 包虫病; 小肠组织; Illumina转录组测序; 新转录本;
【英文关键词】 Kazakh Sheep; Cystic echinococcosis; small intestine tisssues; illumina RNA-seq; novel transcripts;
【摘要】 前期研究发现具有MHC-DRB1基因单倍型MvaⅠbc-SacⅡab-HinlⅠab的哈萨克绵羊对包虫病具有很强的抵抗能力,但具体机制尚不明确,推测可能与可变剪切形成的小肠组织新转录本具有密切关系,因此,本研究采用PCR-RFLP方法从290只哈萨克绵羊中选择抗病和非抗病个体,分为抗性组(A租)、非抗性组(B组)和空白对照组(C组)。其中A组和B组人工感染包虫病一定时间后,与C组同时宰杀,分别取小肠组织进行Illumina转录组测序,测序结果通过荧光实时定量实验验证后,利用生物信息学方法对各组的新转录本进行预测和分析。结果显示:qRT-PCR验证实验表明转录组测序结果可信度较高,通过生物信息学方法分别从A、B和C组样本中预测出1393、1260、1097个,共计3750个新转录本。转录本所含外显子数与其生物功能多样性具有密切联系,研究发现3个组样品中含有2个以上外显子的新转录本占34.64%(1299个)。研究发现哈萨克绵羊感染包虫病后小肠组织新转录本显著增多,与C组相比A组和B组分别增加了26.98%和14.86%。KEGG Pathway富集分析结果表明,新转录本所对应的差异表达基因被富集到了自然杀伤细胞...
【英文摘要】 It has been proved that the Kazakh sheep with MHC-DRB1 haplotype, Mva Ibc-Sac IIab-Hin1 Iab, had a strong resistance on Cystic ehinococcosis(CE). However, the mechanism is still unclear. It is supposed that disease resistance is closely allied to novel transcripts result from alternative splicing in small intestine tissues. So the PCR-RFLP were employed to select the disease resistant and non-resistant Kazakh sheep. Sheep were grouped as follows: group A, The sheep with the MHC-DRB1 Mva Ibc-Sac IIab-Hin1 Ia...
【基金】 国家自然科学基金项目(31260535); 石河子大学大学优秀青年科技培育计划项目(2013ZRKXYQ13);石河子大学动植物育种专项(XJS2013-YZ09)
【更新日期】 2017-08-25
【分类号】 S858.26
【正文快照】 棘球蚴病(Echinocossosis)俗称包虫病,是由棘球蚴寄生在人、牛、羊和犬等动物脏器一种人畜共患病[1]。该疾病在全世界范围的广泛流行,新疆是我国主要发病区之一,2014年对新疆十四个地州人畜感染包虫病情况调查显示;绵羊的感染率为10%-70%,造成的经济损失预计约6亿元左右[2],对?

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