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基于基因组测序数据的梅山猪保种现状分析  
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【英文篇名】 Exploring the Current Situation of Conservation of Meishan Pigs Based on Genome Sequencing Data
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【作者】 孙浩; 王振; 张哲; 肖倩; 徐忠; 张向喆; 杨红杰; 朱满兴; 薛明; 刘晓辉; 张文俊; 郑友民; 王起山; 潘玉春;
【英文作者】 SUN Hao; WANG Zhen; ZHANG Zhe; XIAO Qian; XU Zhong; ZHANG Xiang-zhe; YANG Hong-jie; ZHU Man-xing; XUE Ming; LIU Xiao-hui; ZHANG Wen-jun; ZHENG You-ming; WANG Qi-shan; PAN Yu-chun; School of Agriculture and Biology; Shanghai Jiaotong University; Shanghai Key Laboratory of Veterinary Biotechnology; National Station of Animal Husbandry; Jiangshu Station of Animal Husbandry;
【作者单位】 上海交通大学农业与生物学院; 上海市兽医生物技术重点实验室; 全国畜牧总站; 江苏省畜牧总站;
【文献出处】 上海交通大学学报(农业科学版) , Journal of Shanghai Jiaotong University(Agricultural Science), 编辑部邮箱 2017年 04期  
期刊荣誉:ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 梅山猪; 测序数据; 遗传多样性; 遗传结构;
【英文关键词】 Meishan pig; sequencing data; genetic diversity; genetic structure;
【摘要】 梅山猪是我国太湖流域优良地方品种之一,以繁殖力高和肉质鲜美闻名于世。为探究这一珍贵遗传资源的保种现状,本研究利用4家梅山猪保种场的143头梅山猪简化基因组测序数据,对现有群体的遗传多样性及遗传结构进行了分析。结果表明,各保种场群体有效含量均处于严重威胁状态,群体有效含量(Ne)小于65;中梅山群体具较高的多态标记比,小梅山群体具较高的观测杂合度与期望杂合度;小梅山与中梅山2类型间存在较大遗传分化,群体分化指数(Fst)为0.111,遗传距离(D)为0.287;2个小梅山保种场群体间的遗传分化较弱(Fst=0.055,D=0.239),而2个中梅山保种场群体间则达到中等程度遗传分化(Fst=0.127,D=0.273)。本研究利用测序数据首次全面揭示了现有梅山猪保种群体的遗传多样性与遗传结构关系,为更好地保护与利用梅山猪提供了分子依据。
【英文摘要】 Chinese Meishan pig is well-known for its high prolificacy and superior meat quality.In order to detect the current situation of the conservation population,the sequencing data of 143 pigs from the four state-owned conservation farms were selected in this study.We found that all of the farms have low effective population sizes.The Middle Meishan populations have a higher proportion of polymorphic markers,and the Small Meishan populations have a higher observed heterozygosity and expected heterozygosity.It h...
【基金】 2011-2016年农业部物种资源保护项目(31272414); 上海市生猪产业技术体系建设[沪农科产字(2016)第6号]
【更新日期】 2017-11-03
【分类号】 S828
【正文快照】 梅山猪是太湖流域著名的地方品种之一,以繁殖力高和肉质鲜美闻名于世,被誉为“世界级产仔冠军”[1]。依据体型大小,可将其分为中梅山和小梅山2种类型。上世纪中叶,因外来猪种引入,人们重视杂交利用而忽视纯种繁育,使得梅山猪血缘混杂,纯种数量严重下降,其中小梅山猪尤为突出[2-

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