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基于线粒体16S rRNA探讨渤海海区矮拟帽贝的种群生态遗传  
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【英文篇名】 Population Ecological Genetics of Patelloida pygmaea Based on Mitochondrial 16S rRNA Fragment Sequences in the Bohai Sea
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【作者】 史博洋; 李媛媛; 王儒晓; 曲江勇; 郭承华; 刘传林; 侯建海; 房辉; 刘楚童;
【英文作者】 SHI Boyang; LI Yuanyuan; WANG Ruxiao; QU Jiangyong; GUO Chenghua; LIU Chuanlin; HOU Jianhai; FANG Hui; LIU Chutong; College of Life Sciences; Yantai University; Hainan Key Laboratory for Herpetological Research; Hainan Tropical Ocean University;
【作者单位】 烟台大学生命科学学院; 海南热带海洋学院海南两栖爬行动物研究重点实验室;
【文献出处】 四川动物 , Sichuan Journal of Zoology, 编辑部邮箱 2017年 04期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 矮拟帽贝; 16S rRNA; 生态遗传; 遗传多样性;
【英文关键词】 Patelloida pygmaea; 16S rRNA; ecological genetical; genetic diversity;
【摘要】 采用聚合酶链式反应和直接测序的方法研究了渤海海区15个矮拟帽贝Patelloida pygmaea种群遗传多样性与环境因子的关系。180个个体的16S rRNA部分序列(615 bp)共发现264个多态性位点,153个转换,114个颠换,界定32个单倍型。所有个体碱基含量依次为C(18.12%)、T(27.74%)、A(33.07%)、G(21.07%);单倍型多样性为0.835 1±0.019 1,核苷酸多样性为0.449±0.214。矮拟帽贝大陆沿岸种群核苷酸多样性(0.191 8±0.091 7)高于岛屿种群(0.107 3±0.081 6)。种群历史动态结果显示,矮拟帽贝经历了种群近期扩张。与环境因子相关性研究发现,遗传距离、序列变异、核苷酸多样性与日照时数、日照百分率分别呈显著正相关(P<0.05);形态相关分析结果表明,变异主成分(壳长、壳宽)与年均降水量呈显著负相关(P<0.05);年均降水量、日照时数、日照百分率是影响矮拟帽贝形态变异、遗传多样性的主导因子,环境越稳定地区种群的遗传多样性越高。
【英文摘要】 The relationship between genetic diversity and environmental factors of 15 Patelloida pygmaea populations in the Bohai Sea was studied by PCR and DNA sequencing. A total of 264 polymorphic loci were found in the 16 S rRNA partial sequence of the 180 individuals,and 153 transitions as well as 114 transversions were defined by 32 haplotypes. The base contents of C,T,A and G were 18. 12%,27. 74%,33. 07%,and 21. 07%,respectively. The haplotype diversity was0. 835 1 ± 0. 019 1,and the nucleotide diversity was 0....
【基金】 国家自然科学基金地区基金项目(31460562); 烟台大学博士科研启动经费(SM15B01);烟台大学研究生科技创新基金项目;烟台大学开放实验室项目; 2016年国家级大学生创新创业训练计划项目(201611066009)
【更新日期】 2017-08-17
【分类号】 Q953
【正文快照】 环境因子在物种的进化过程中发挥着重要作用,物种的分布、行为、生理和遗传结构通常都会受到环境因子的影响,探究环境因子与生物多样性的相关性是生态遗传研究的重要内容之一(Scheiner,1993)。通常种群占据不同地理环境并呈现梯度性遗传变化,这种结果主要受自然选择与环境变迁?

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