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【英文篇名】 |
F-MSAP sampling strategy and genetic diversity analysis of Castanopsis chinensis in South China Botanical Garden |
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【下载频次】 |
★★★★ |
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【作者】 |
刘孟;
欧阳学军;
陈洁;
全慧敏;
叶万辉;
刘卫; |
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【英文作者】 |
LIU Meng;
OUYANG Xue-Jun;
CHEN Jie;
QUAN Hui-Min;
YE Wan-Hui;
LIU Wei;
South China Botanical Garden;
Chinese Academy of Sciences;
Dinghushan Arboretum; |
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【作者单位】 |
中国科学院华南植物园;
中国科学院华南植物研究所鼎湖山树木园; |
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【文献出处】 |
广西植物
, Guihaia, 编辑部邮箱
2017年 01期
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 中国期刊方阵 CJFD收录刊 |
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【中文关键词】 |
锥栗;
甲基化;
F-MSAP;
引物筛选;
样品保存; |
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【英文关键词】 |
Castanopsis chinensis;
methylation;
F-MSAP;
primer selection;
sample preservation; |
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【摘要】 |
基因组甲基化修饰受环境因素的影响。在以甲基化为代表的表观遗传学研究中,如何减少保存环境对异地采后样品的影响,提高整个实验的准确性和科学性,目前尚未有系统的认知。该研究选取5种常用的采后样品保存方式(液氮冷冻、-20℃冷冻、变色硅胶干燥、密封袋密封、75%酒精浸泡),分别用Wilcoxon signed ranks tests统计分析和UPGMA聚类分析方法,对华南植物园锥栗进行F-MSAP研究,以期找出最佳保存方式。同时,利用正交试验法对F-MSAP体系进行优化,筛选出9对引物(E3-H/M2;E5-H/M2;E6-H/M1;E6-H/M5;E8-H/M1;E8-H/M5;E9-H/M2;E11-H/M5;E14-H/M1),并对不同发育时期的锥栗甲基化水平及遗传多样性进行了论述。结果表明:在锥栗F-MSAP的研究中,Willcoxon signed ranks tests统计分析和UPGMA聚类分析结论一致,密封袋保存效果最佳;成熟叶半甲基化率(27.83%)和总甲基化率(51.13%)高于幼叶(21.35%,45.90%),全甲基化率(23.30%)低于幼叶(24.55%),平均多态位点百分数39.60%... |
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【英文摘要】 |
Genomic methylation characteristics were influenced by environmental factors. In the study of epigenetics,represented by DNA methylation,the preservation environmental of postharvest samples,especially the samples in the remote place,would have an influence on the later experiment. In this reason,standard sampling and preserve operation were crucial in the field of epigenetic. But the related research was few. Therefore,we studied Castanopsis chinensis in South China Botanical Garden with F-MSAP sampling st... |
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【基金】 |
国家自然科学基金(311251001)~~ |
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【更新日期】 |
2017-02-20 |
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【分类号】 |
Q943 |
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【正文快照】 |
目前已有研究证据证明DNA甲基化这种重要的表观遗传方式,在植物生长发育及进化过程中起着重要的调节作用,并显著影响所在DNA区域的遗传变异速率(Johannes et al,2009;Paun et al,2010;Angers et al,2010)。近年来,DNA甲基化已成为生物学研究的热点之一,特别在植物学研究上,由于 |
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