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Cupriavidus gilardii CR3全基因组双组份系统鉴定和生物信息学分析  
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【英文篇名】 Identification and Bioinformatics Analysis of Two-Component System in Genome-Wide Cupriavidus gilardii CR3
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【作者】 王艳; 黄宁; 余水静; 周丹丹; 王小雨;
【英文作者】 Wang Yan; Huang Ning; Yu Shuijing; Zhou Dandan; Wang Xiaoyu; Northeast Normal University; Jiangxi University of Science and Technology;
【作者单位】 东北师范大学; 江西理工大学;
【文献出处】 基因组学与应用生物学 , Genomics and Applied Biology, 编辑部邮箱 2017年 11期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 贪铜菌属; 双组份信号传导系统; 组氨酸激酶; 反应调节因子; 全基因组分析;
【英文关键词】 Cupriavidus sp.; Two-component signal transduction system; Histidine kinase; Response regulator; Genome-wide analysis;
【摘要】 双组份信号传导系统(TCS)是细菌最常见的膜传导系统,在细菌对外界环境胁迫响应机制中发挥着的重要作用。贪铜菌属细菌是典型的重金属抗性细菌,对多种重金属具有抗性。但是,迄今为止,有关贪铜菌的TCS研究尚不多见。本研究基于前期研究结果,运用全基因组生物信息学分析的方法,以Cupriavidus gilardii CR3为模式菌株,鉴定和分析了Cupriavidus gilardii的双组份信号传导系统基因分布及编码蛋白结构特征。结果表明,Cupriavidus gilardii CR3共有96个双组份信号系统基因。其中,有22个组氨酸激酶基因和反应调节因子成对存在组成双组份信号传导系统,12个融合组氨酸激酶,13个孤儿组氨酸激酶和27个孤儿反应调节因子。与已有文献报道的Cupriavidus metallidurans CH34、Cupriavidus necator N-1和Cupriavidus taiwanensis LMG 19424的双组分信号传导系统相比,Cupriavidus gilardii CR3的双组份信号系统较少,而融合组氨酸激酶和孤儿反应调节因子所占比例较大。Cupriavidus gil...
【英文摘要】 Two-component systems(TCS) are commonly used for transmembrane signal transduction in bacteria,They play an important role in the adaptation mechanisms between bacteria and the environment.The genus Cupriavidus is a typical heavy metal-resistant bacterium,having resistance to various heavy metals.However,there were few studies of TCS in Cupriavidus yet.Based on the results of previous researches and the method of genome-wide bioinformatics analysis,this study used Cupriavidus gilardii CR3 as type strain,ide...
【基金】 国家自然科学基金(No.31170476,No.51678122); 吉林省科技厅项目(No.20150414046 GH)共同资助
【更新日期】 2018-01-03
【分类号】 Q811.4
【正文快照】 *通讯作者,xywang@nenu.edu.cnIdentification and Bioinformatics Analysis of Two-Component System inGenome-Wide Cupriavidus gilardii CR3Wang Yan1Huang Ning1Yu Shuijing2Zhou Dandan1Wang Xiaoyu1*1 Northeast Normal University,Changchun,130117;2 Jiangxi Universi

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