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非优异SSR原因分析及解决方案  
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【英文篇名】 The Reason Analysis and Solution about Imperfect SSR
【下载频次】 ★★★
【作者】 刘文彬; 许理文; 冯博; 易红梅; 任洁; 田红丽; 赵涵; 吕远大; 蔚荣海; 赵久然; 王凤格;
【英文作者】 Liu Wenbin; Xu Liwen; Feng Bo; Yi Hongmei; Ren Jie; Tian Hongli; Zhao Han; Lv Yuanda; Yu Ronghai; Zhao Jiuran; Wang Fengge; College of Agriculture; Jilin Agricultural University; Beijing Key Laboratory of Maize DNA Fingerprinting and Molecular Breeding; Maize Research Center; Beijing Academy of Agriculture & Forestry Sciences; Institute of Agricultural Biotechnology; Jiangsu Academy of Agricultural Sciences;
【作者单位】 吉林农业大学农学院; 北京市农林科学院玉米研究中心玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室; 江苏省农业科学院农业生物技术研究所;
【文献出处】 分子植物育种 , Molecular Plant Breeding, 编辑部邮箱 2017年 11期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 优异SSR; 非特异峰; N 1峰; 测序; 重新设计;
【英文关键词】 Perfect SSR; Nonspecial peak; N 1 peak; Sequencing; Redesign;
【摘要】 SSR标记在真实性检测、纯度鉴定、以及指纹库构建中起着至关重要的作用。在其筛选过程中会遇到许多具有N+1峰等异常峰型、非特异性峰、多态性低、不适于软件自动分析等非优异SSR引物。为了解并掌握非优异SSR引物表现以及形成原因,本研究以22份初筛材料、27套三联体材料及95份自交系对新型SSR引物进行评估筛选,从中选取有代表性的11对SSR引物,现在已对10种非优异SSR引物表现进行描述,分析形成原因,通过测序对一对引物进行重新设计,并获得较好效果。
【英文摘要】 SSR markers play an important role in authenticity detection, purity identification and fingerprint library building In the process of SSR primers screening will meet imperfect SSR primers, such as N +1 peak and other abnormal peak, nonspecific peak, low polymorphism and not suitable for automatic analysis software. In order to understand and master the performance and the reasons about imperfect SSR primers, in this study, using22 materials about first screening, 27 sets of mother-father-child trios and 95...
【基金】 科技部国家科技支撑计划(2015BAD02B02); 北京市农林科学院院科技创新能力建设专项(KJCX20161501)共同资助
【更新日期】 2018-01-05
【分类号】 Q943.2
【正文快照】 SSR分子标记已被广泛用于玉米、大豆、水稻、刚,2016),优异的SSR引物在玉米真实性、纯度、种棉花等作物基因定位及资源分析等方面(楚渠和孟质资源鉴定中以及DNA指纹库构建等研究中起着 至关重要的作用(王凤格等,2006)。于新艳等(2007)1.2可以改善的非优异SSR引物表现对不符合?

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