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棉花中HD-Zip Ⅳ家族基因的全基因组鉴定及特征分析  
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【英文篇名】 Genome-wide Identification and Characterization of The HD-Zip Ⅳ Gene Family in Cotton(Gossypium spp.)
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【作者】 王瑞; 鲁丽丽; 刘拓; 章志强; 马宗斌; 李伶俐; 刘伟; 杨作仁; 朱伟;
【英文作者】 Wang Rui; Lu Lili; Liu Tuo; Zhang Zhiqiang; Ma Zongbin; Li Lingli; Liu Wei; Yang Zuoren; Zhu Wei; College of Agronomy; Henan Agricultural University; Zhengzhou Research Center of Cotton Research Institute; Chinese Academy of Agricultural Sciences; State Key Laboratory of Cotton Biology;
【作者单位】 河南农业大学农学院; 中国农业科学院棉花研究所郑州科研中心棉花生物学国家重点实验室;
【文献出处】 分子植物育种 , Molecular Plant Breeding, 编辑部邮箱 2017年 08期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 棉花; HD-Zip转录因子; 基因家族; 差异表达;
【英文关键词】 Cotton; HD-Zip transcription factors; Gene family; Differential expression;
【摘要】 同源异型亮氨酸拉链蛋白(homeodomain-leucine zipper,HD-Zip)是高等植物特有的一类转录因子,分成Ⅰ~Ⅳ4个亚家族。HD-ZipⅣ转录因子主要参与表皮结构的发育调控,在其他作物中已经广泛研究,但是棉花中还未进行系统的分析。本研究中,我们分别对陆地棉、亚洲棉、雷蒙德氏棉进行全基因组的鉴定,分别得到15个、12个、14个HD-ZipⅣ基因。除一个雷蒙德氏棉基因发生丢失外,陆地棉中几乎保留了所有的亚洲棉、雷蒙德氏棉中的HD-ZipⅣ基因。分析表明这些基因编码的蛋白都有HD-ZipⅣ转录因子特征性的结构域,且进化树上关系近的成员拥有相似的基因结构和基序组成。大部分陆地棉HD-ZipⅣ基因经历了纯化选择,且有一些经历正向选择。同时,进一步分析得出结论:片段复制在陆地棉HD-ZipⅣ基因的演化中起重要作用。组织表达分析表明大部分HD-ZipⅣ基因主要在发育着的胚珠和纤维中表达,暗示该家族与棉花中种子形成、纤维发育有关。总之,本研究为棉花中HD-ZipⅣ基因的功能研究及应用提供了参考依据。
【英文摘要】 The homeodomain-leucine zipper protein(HD-Zip) is a specific transcription factor in higher plants and has been further classified into four subfamilies from Ⅰ~Ⅳ. HD-Zip Ⅳ transcription factors play a major role in developmental regulation of epidermal structures. Although this gene family has been extensively investigated in several plant species, no systematic analysis of HD-Zip Ⅳ genes has been carried out in cotton. Here, we performed a genome-wide survey and identified 15, 12, 14 HD-Zip Ⅳ genes in G. h...
【基金】 国家自然基金项目(U1204312); 河南省棉花产业技术体系建设专项(S2013-07-G04); 郑州市科技计划项目(153PXXCY180)共同资助
【更新日期】 2017-09-08
【分类号】 Q943.2;S562
【正文快照】 Genome-wide Identification and Characterization of The HD-ZipⅣGeneFamily in Cotton(Gossypium spp.)Wang Rui1,2Lu Lili2Liu Tuo1Zhang Zhiqiang1,2Ma Zongbin1Li Lingli1Liu Wei1Yang Zuoren2Zhu Wei1*1 College of Agronomy,Henan Agricultural University,Zhengzhou,

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