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蛋白质-RNA对接中打分函数设计及RNA结合位点识别研究进展  
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【英文篇名】 Research Progresses on Scoring Function Design and RNA-binding Site Identification in Protein-RNA Docking
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【作者】 李春华; 刘洋; 陆林; 马梦琳; 谭建军; 张小轶; 王存新;
【英文作者】 LI Chunhua; LIU Yang; LU Lin; MA Menglin; TAN Jianjun; ZHANG Xiaoyi; WANG Cunxin; College of Life Science and Bioengineering; Beijing University of Technology;
【作者单位】 北京工业大学生命科学与生物工程学院;
【文献出处】 北京工业大学学报 , Journal of Beijing University of Technology, 编辑部邮箱 2017年 12期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 蛋白质-RNA相互作用; 分子对接; 打分函数; RNA结合位点预测;
【英文关键词】 protein-RNA interactions; molecular docking; scoring function; RNA-binding site prediction;
【摘要】 分子对接是目前研究蛋白质-RNA相互作用与识别的有效方法之一.其中,打分函数的合理设计与分子结合位点的准确识别对成功预测蛋白质-RNA复合物结构至关重要.结合小组的工作,对用分子对接方法预测蛋白质-RNA复合物结构中所涉及2个关键性问题(即分子对接打分函数的设计和RNA结合位点的预测)及研究进展进行了回顾,并对几种常用的方法进行了比较.最后分析了这两方面研究目前所存在的主要问题,并对未来的发展方向进行了展望.
【英文摘要】 Molecular docking is one of the effective methods for studying the interaction and recognition between protein and RNA. The reasonable design of scoring functions and accurate RNA-binding site identification are critical to the successful prediction of protein-RNA complex structures. In this paper,the research progresses on the two important aspects involved in protein-RNA docking study including scoring function design and RNA-binding site prediction were reviewed. And a comparison for these currently prop...
【基金】 国家自然科学基金资助项目(11474013); 北京市自然科学基金资助项目(4152011)
【更新日期】 2017-12-15
【分类号】 Q75
【正文快照】 蛋白质-RNA之间的相互作用与识别与生物体内的多种生命活动密切相关,如基因的表达调控、蛋白质的合成和病毒复制等.RNA既是信息分子,又是功能分子,在其众多行为的完成中,如mRNA的转录、剪切、出核、定位、翻译和降解等过程中,mRNA要和一系列蛋白质结合并受它们的调控[1-3].更为

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