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基于RNA-Seq的稻瘟病菌Δznf1突变体的表达谱分析  
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【英文篇名】 Analysis of RNA-Seq-Based Expression Profiles of Δznf1 Mutants in Magnaporthe oryzae
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【作者】 岳晓凤; 阙亚伟; 王政逸;
【英文作者】 YUE Xiao-feng; QUE Ya-wei; WANG Zheng-yi; State Key Laboratory for Rice Biology; Institute of Agriculture and Biotechnology; Zhejiang University;
【作者单位】 浙江大学农业与生物技术学院水稻生物学国家重点实验室;
【文献出处】 中国农业科学 , Scientia Agricultura Sinica, 编辑部邮箱 2016年 17期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 水稻; 稻瘟病菌; 附着胞; Δznf1; RNA-Seq; 差异表达基因;
【英文关键词】 rice; Magnaporthe oryzae; appressorium; Δznf1; RNA-Seq; differentially expressed genes;
【摘要】 【目的】稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)引起的水稻稻瘟病是威胁全球水稻生产的重要病害之一,而该菌附着胞介导的侵染又是病害循环的重要环节。在前期的研究中发现一个编码C_2H_2锌指结构的转录因子基因ZNF1,参与稻瘟病菌附着胞形成、穿透和致病过程,论文旨在从转录水平上了解受Znf1调控的基因及其调控机理,为深入研究稻瘟病菌致病分子机理提供基础数据。【方法】利用RNA-Seq技术对稻瘟病菌野生型菌株Guy11和突变体Δznf1的营养菌丝体进行表达谱测序,采用FPKM法计算基因表达量,以FDR≤0.001且log2 ratio(Δznf1/Guy11)≥1为筛选标准,获得Δznf1中差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs);通过与Gene Ontology(GO)数据库和KEGG Pathway数据库比对,获得差异基因可能的生物学功能和参与的分子调控途径。为了更详细地研究受Znf1调控的基因,在同样的条件下,利用RNA-Seq技术对稻瘟病菌丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)编码基因PMK1的缺...
【英文摘要】 【Objective】Magnaporthe oryzae is the causal agent of rice blast, which is one of the most important disease threatening the production of cultivated rice worldwide. Appressorium-mediated penetration is a key step in the disease cycle of the fungus. Previously, it was reported that a C2H2 zinc finger transcription factor encoded by ZNF1 is essential for appressorium development, penetration and pathogenicity in the rice blast fungus. The objective of this study is to understand the regulatory mechanism of Zn...
【基金】 国家重点基础研究发展计划(“973”计划)(2012CB114002); 国家自然科学基金(31370172)
【更新日期】 2016-09-26
【分类号】 S435.111.41
【正文快照】 0引言 【研究意义】稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)侵染水稻引起的稻瘟病是水稻上的重要病害,每年可造成10%—30%的稻谷产量损失,严重威胁世界各水稻产区粮食生产安全[1]。由于经济的重要性和分子遗传的可操作性,稻瘟病菌-水稻互作机制已成为研究病原菌-寄主植物互作的模式系统

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