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巴马香猪周身皮肤厚度的测量及其与7号染色体候选SNPs位点的关联分析  
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【英文篇名】 Measurement of Skin Thickness Along the Whole Body Sites and Association Study with Candidate SNPs on Sus Scrofa Chromosome 7 in Bamaxiang Pigs
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【作者】 黄涛; 黄晓畅; 邱恒清; 严国荣; 黄贻忠; 张弋峰; 江嘉程; 周李生; 任军; 麻骏武; 肖石军; 黄路生; 杨斌; 艾华水;
【英文作者】 HUANG Tao; HUANG Xiao-chang; QIU Heng-qing; YAN Guo-rong; HUANG Yi-zhong; ZHANG Yi-feng; JIANG Jia-cheng; ZHOU Li-sheng; REN Jun; MA Jun-wu; XIAO Shi-jun; HUANG Lu-sheng; YANG Bin; AI Hua-shui; National Key Laboratory for Pig Genetic Improvement and Production Technology; Jiangxi Agricultural University;
【作者单位】 江西农业大学省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室;
【文献出处】 中国农业科学 , Scientia Agricultura Sinica, 编辑部邮箱 2016年 16期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 巴马香猪; 皮肤厚度; 候选SNPs位点; 关联分析;
【英文关键词】 Bamaxiang pigs; skin thickness; candidate SNP sites; association study;
【摘要】 【目的】测定中国地方小型猪品种巴马香猪成年时周身9个典型部位的皮肤厚度,揭示巴马香猪不同部位皮肤厚度变化规律,进行9个部位皮肤厚度与候选SNPs位点的关联分析,在巴马香猪群体中验证影响皮肤厚度的7号染色体主效QTL,为进一步在巴马香猪群体中大规模开展皮肤厚度等形态变化的分子遗传控制机理及其相关基因功能研究奠定基础,从而增强人们对猪皮肤的认知。【方法】从一个由319头300日龄巴马香猪组成的成年屠宰群体中,随机选取50头,包括27头母猪和23头阉割公猪,分别取头脸、肩、背、肷、臀、胸、下腹、腋下和管等9个部位的皮肤,利用电子游标卡尺对这些不同部位皮肤厚度进行精确测量,利用R语言基本统计包进行不同部位和不同性别间皮肤厚度的差异分析以及不同部位间皮肤厚度的相关分析。在猪7号染色体34.5-36.2Mb的区域选取46个SNPs位点,利用MassARRAY时间飞行质谱技术进行基因分型,结合上述测定的皮厚表型,利用广义混合线性模型及R语言SNPassoc软件包进行目标候选区域的关联分析。根据关联分析结果和基因的生物学功能确定可能的位置候选基因。【结果】(1)单因素方差分析表明巴马香猪9个部位的皮肤厚度存在极显著差异(P=...
【英文摘要】 【Objective】Skin thickness at 9 typical sites of the whole pig body were measured in Bamaxiang pig breed,one of the Chinese local miniature pig breeds.There are 46 candidate SNPs located in a major QTL affecting skin thickness on sus scrofa chromosome 7(SSC7) were genotyped in the Bamaxiang pig population.One aim of this study is to make clear variation rule of skin thickness at different body sites in Bamaxiang pigs.The other aim is to verify the major QTL affecting skin thickness on SSC7 in Bamaxiang pig p...
【基金】 国家自然科学基金(31460283)
【更新日期】 2016-09-05
【分类号】 S828
【正文快照】 Measurement of Skin Thickness Along the Whole Body Sites andAssociation Study with Candidate SNPs on Sus ScrofaChromosome 7 in Bamaxiang PigsHUANG Tao,HUANG Xiao-chang,QIU Heng-qing,YAN Guo-rong,HUANG Yi-zhong,ZHANG Yi-feng,JIANG Jia-cheng,ZHOU Li-sheng,R

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