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一种新型肿瘤组织起源分子标志物的建立与评价  
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【英文篇名】 Identification and validation of a novel gene expression signature for diagnosing tumor tissue origin
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【作者】 王奇峰; 徐清华; 陈金影; 钱琛晖; 刘晓健; 杜祥;
【英文作者】 WANG Qifeng; XU Qinghua; CHEN Jinying; QIAN Chenhui; LIU Xiaojian; DU Xiang; Department of Pathology; Fudan University Shanghai Cancer Center; Department of Oncology; Shanghai Medical College; Fudan University; Canhelp Genomics Co.; Ltd; Department of Chemotherapy;
【作者单位】 复旦大学附属肿瘤医院病理科复旦大学上海医学院肿瘤学系; 杭州可帮基因科技有限公司; 复旦大学附属肿瘤医院化疗科复旦大学上海医学院肿瘤学系;
【文献出处】 中国癌症杂志 , China Oncology, 编辑部邮箱 2016年 10期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  CJFD收录刊
【中文关键词】 原发灶不明恶性肿瘤; 肿瘤组织起源; 基因表达谱; 实时定量聚合酶链反应; 免疫组化;
【英文关键词】 Cancer of unknown primary; Tumor tissue origin; Gene expression profiling; Real-time quantitative polymerase chain reaction; Immunohistochemistry;
【摘要】 背景与目的:原发灶不明恶性肿瘤是一类转移性肿瘤的统称,在诊断时无法找到原发位点,约占所有恶性肿瘤的5%~10%。明确肿瘤的组织起源对于患者的诊断和治疗具有重要意义。方法:整合Array Express和Gene Expression Omnibus数据库中肿瘤类型明确的样本数据,构建涵盖22种常见肿瘤类型、5 800例样本的基因表达谱数据库;通过支持向量机递归特征消除算法筛选组织特异性基因,建立肿瘤分类模型;采用实时定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,RTQ-PCR)检测石蜡包埋肿瘤组织中基因的表达水平,并将基因分型结果与病理诊断结果进行比较。结果:基于肿瘤基因表达谱大数据,筛选出96个组织特异性基因,其中包含常见的肿瘤相关基因,如钙黏蛋白1(cadherin 1,CDH1)、激肽释放酶相关酶3(kallikreinrelated peptidase 3,KLK3)和表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)等。在206例石蜡包埋组织样本中,182例的基因分型结果与病理诊断结果一...
【英文摘要】 Background and purpose: Cancer of unknown primary(CUP) represents approximately 5%~10% of malignant neoplasms. For CUP patients, identification of tumor origin allows for more specific therapeutic regimens and improves outcomes. Methods: By retrieving the gene expression data from Array Express and Gene Expression Omnibus data repositories, we established a comprehensive gene expression database of 5 800 tumor samples encompassing 22 main tumor types. The support vector machine-recursive feature elimination...
【更新日期】 2016-12-07
【分类号】 R730.43
【正文快照】 Identification and validation of a novel gene expression signature for diagnosing tumor tissue originWANG Qifeng1,XU Qinghua2,CHEN Jinying2,QIAN Chenhui2,LIU Xiaojian3,DU Xiang1(1.Departmentof Pathology,Fudan University Shanghai Cancer Center,Department o

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