贵州省儿童手足口病非CVA16、非EV71肠道病毒的鉴定及其VP1基因分型研究

【摘要】 目的为探讨2012-2013年贵州省儿童手足口病非CVA16、非EV71肠道病毒株的毒株型别及分子进化特征,从而为制订防治手足口病的措施提供科学依据。方法收集2012~2013年贵州省儿童手足口病疑似患者肛拭子200例标本,应用实时荧光逆转录-聚合酶链反应法筛选,获得非EV71、非CVA16型肠道病毒株。提取所得病毒核酸,采用RT-PCR法扩增病毒VP1区序列,PCR阳性扩增产物进行测序,对测得序列进行型别鉴定,并与国内外各型代表株进行核苷酸、氨基酸同源性比较,构建系统进化树。结果本研究共分离到6株非CVA16、非EV71毒株,分别为:CVA5 2株,CVA2、CVA4、CVB2、E16各1株。分别归属Cox A、Cox B、埃可肠道病毒。同源性分析显示,6株毒株与其代表株核苷酸序列均存在不同程度的差异。系统进化树表明,CVA4、CVB2、E16与国内分离株存在一定亲缘关系,而CVA2、CVA5与国内外分离株亲缘关系较远。结论贵州省儿童手足口病的病原以非CVA16、非EV71肠道病毒株为主要类别。更多还原