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基因组信息指导的星海链霉菌中2-甲硫基-N~6-(4-羟基异戊烯基)-腺苷的分离鉴定  
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【英文篇名】 Genome guided identification of 2-methylthio-N~6-(4-hydroxyisopentenyl)-adenosine from Streptomyces xinghaiensis NRRL B24674~T
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【作者】 王晓庆; 王晓政; 陈亮宇; 赵心清; 黄婷婷; 林双君;
【英文作者】 Xiaoqing Wang; Xiaozheng Wang; Liangyu Chen; Xinqing Zhao; Tingting Huang; Shuangjun Lin; State Key Laboratory of Microbial Metabolism; Joint International Laboratory on Metabolic & Developmental Sciences; School of Life Sciences and Biotechnology; Shanghai Jiao Tong University; School of Life Science and Biotechnology; Dalian University of Technology;
【作者单位】 上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室教育部代谢与发育科学国际合作联合实验室; 大连理工大学生命科学技术学院;
【文献出处】 微生物学报 , Acta Microbiologica Sinica, 编辑部邮箱 2016年 05期  
期刊荣誉：中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 星海链霉菌; 基因组挖掘; 2-甲硫基-N6-(4-羟基异戊烯基)-腺苷; 腺苷修饰;
【英文关键词】 Streptomyces xinghaiensis; genome mining; 2-methylthio-N6-(4-hydroxyisopentenyl)-adenosine; adenine modification;
【摘要】 【目的】研究海洋链霉菌新种星海链霉菌Streptomyces xinghaiensis NRRL B24674~T次级代谢物中是否存在2-甲硫基-N~6-异戊烯基修饰的腺苷。【方法】通过生物信息学分析星海链霉菌S.xinghaiensis NRRL B24674~T基因组序列,寻找这类化合物的生物合成相关基因;采用正相硅胶柱色谱、反相硅胶柱色谱、凝胶柱色谱和高效液相色谱等分离技术对该菌株的发酵粗提物进行分离纯化;利用质谱与核磁共振等波谱技术鉴定化合物的结构。【结果】在星海链霉菌基因组中找到含有2-甲硫基-N~6-异戊烯基修饰的化合物生物合成途径中的2个同源蛋白;从该菌的发酵液中分离鉴定了2-甲硫基-N~6-(4-羟基异戊烯基)-腺苷(ms2io6A)。【结论】星海链霉菌S.xinghaiensis NRRL B24674~T存在此类腺苷修饰反应,并且是首次在链霉菌中发现此类腺苷修饰。生物信息学分析预示着链霉菌中可能普遍存在此类核酸或者核苷修饰。
【英文摘要】 [Objective] To investigate the production of adenosine modified with N~6-(Δ2-isopentenyl) and 2-thiomethyl groups from marine-derived Streptomyces xinghaiensis NRRL B24674~T. [Methods] Bioinformatics analysis was carried out to search the genome sequence of S. xinghaiensis NRRL B24674~T and the secondary metabolites were purified by silica gel column chromatography, gel chromatography and high-performance liquid chromatography, and the chemical structure was elucidated by nuclear magnetic resonance(NMR) and...
【基金】 国家自然科学基金(31425001)~~
【更新日期】 2016-05-12
【分类号】 Q936
【正文快照】 t RNA的转录后修饰几乎存在于包括古生菌、细菌和真核生物在内的所有生物当中[1]。有趣的是,生物体内存在大量用于t RNA核苷酸的修饰酶[2],从而形成多样的t RNA结构。目前为止,从t RNA中鉴定了100多个被修饰的核苷酸结构(http://medstat.med.utah.edu/RNAmods),例如4-硫尿核苷?

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