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基于16S rRNA基因文库技术分析水性涂料菌群的多样性

Analysis of Waterborne Coating Bacterial Diversity by the 16S rRNA Gene Library

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【作者】 黄小茉陶宏兵邱晓颖李良秋施庆珊

【Author】 HUANG Xiao-mo;TAO Hong-bing;QIU Xiao-ying;LI Liang-qiu;SHI Qing-shan;State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China;Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application,Guangdong Institute of Microbiology;Guangdong Demay Biological Technology Co.,Ltd;

【机构】 广东省微生物研究所,华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东迪美生物技术有限公司

【摘要】 采用未培养技术直接提取变质涂料微生物总DNA,使用通用引物进行PCR扩增、纯化、连接、克隆和测序,建立16S rRNA基因文库,分析变质水性涂料细菌的数量与种类。从96个克隆子中共检测到8种不同种属的细菌,假单胞菌属(Pseudomonas)为优势菌群,占总数的75%,软骨酸芽孢杆菌(Paenibacillus chondroitinus)占总数的15%,此外豚鼠气单胞菌(Aeromonas caviae)和粪产碱杆菌(Alcaligenes faecalis)分别占总数2%。结果表明16S rRNA基因文库是一种较好的研究水性涂料细菌群落多样性的方法。

【Abstract】 Total microbial DNA was directly extracted from a metamorphic waterborne coating,the clone library of 16 S ribosomal RNA genes was amplified using PCR with universal bacterial primer sets. The PCR products were then subcloned into p GEM-T vector,amplified DNA was used for diversity analysis. The total of 96 clones were selected and 8 kinds of microbe which were used for sequencing. Pseudomonas was the most one( 75% of total clones),then was Paenibacillus chondroitinus( 15% of total clones),Aeromonas caviae and Alcaligenes faecalis accounted for 2% of total clones respectively. 16 S rRNA gene library is a good research method for waterborne bacteria community diversity analysis.

【关键词】 水性涂料16S rRNA细菌多样性
【Key words】 waterborne coating16S rRNAbacterialdiversity
【基金】 广东省科技计划项目(2013B090600148;2013B050800023);揭阳市产学研结合项目(201429)资助
  • 【文献出处】 生物技术进展 ,Current Biotechnology , 编辑部邮箱 ,2016年04期
  • 【分类号】TQ637;Q78
  • 【被引频次】4
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