[目的]对拟南芥类受体胞质激酶RBK2(ROP binding protein kinases 2)的结构、分子进化和基因表达等进行预测分析。[方法]利用生物信息学在线相关数据库和分析软件对目的蛋白的基本理化性质、二级及三级结构、同源性、基因表达、蛋白定位、相互作用蛋白进行分析预测。[结果]拟南芥类受体胞质激酶RBK2是一个亲水性不稳定蛋白,主要构成原件为α螺旋及β片状折叠,进化树构建及多序列比对显示其与琴叶拟南芥中名为激酶家族蛋白的蛋白进化距离最近。主要存在于细胞质和细胞核中,其编码基因在成熟花粉中强烈表达,且RBK2与PP2C家族蛋白有较强的相互作用。[结论]拟南芥RBK2很可能通过参与信号转导途径在植物种子萌发、花粉成熟及细胞分裂等方面发挥重要作用。
【英文摘要】
[Objective]To analyze the structure and function of RBK2 in Arabidopsis thaliana using bioinformatics methods.[Methods]The physicochemical property,signal peptides,secondary structure,tertiary structure,homology,gene expression,protein localization,protein- protein interaction were predicted and analyzed by the online network relevant databases and bioinformatics softwares. [Results]RBK2 was a hydrophilic and labile protein,located in the cytoplasm and the nucleus. The secondary structures were mainly compo...
从植物基因组中鉴定出的多个与动物细胞受体激酶(receptor protein kinases,RPKs)同源的基因,其中大部分基因的产物尚未鉴定出配基,将这类蛋白称为类受体蛋白激酶(receptor-like protein kinase,RLKs)[1]。植物类受体蛋白激酶结构上由感知胞外信号的胞外受体域,跨膜结构域以及?
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