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DNA双链区的切割导致碱变性超螺旋质粒pBR322的分子内结节(英文)  
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【英文篇名】 Cleavage of The Double-strand Region in Alkali-denatured Supercoiled Plasmid pBR322 Leads to DNA Nodes
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【作者】 田磊; 苏小运; 张臻峰; 黄熙泰;
【英文作者】 TIAN Lei; SU Xiao-Yun; ZHANG Zhen-Feng; HUANG Xi-Tai; Department of General Surgery; Navy General Hospital; Key Laboratory for Feed Biotechnology of The Ministry of Agriculture; Feed Research Institute; Chinese Academy of Agricultural Sciences; State Key Laboratory of Microbial Resources; Institute of Microbiology; Chinese Academy of Sciences; Department of Biochemistry and Molecular Biology; College of Life Sciences; Nankai University;
【作者单位】 中国人民解放军海军总医院普外科; 中国农业科学院饲料研究所; 中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室; 南开大学生命科学学院;
【文献出处】 生物化学与生物物理进展 , Progress in Biochemistry and Biophysics, 编辑部邮箱 2016年 08期  
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览  ASPT来源刊  中国期刊方阵  CJFD收录刊
【中文关键词】 DNAⅣ; 限制性内切酶; DNA拓扑异构酶; DNA结节; 原子力显微镜;
【英文关键词】 DNA Ⅳ; restriction enzyme; DNA topoisomerase; DNA nodes; atomic force microscopy(AFM);
【摘要】 为进一步研究碱变性超螺旋D NA(Ⅳ型D NA;DNAⅣ)的结构,对碱变性质粒p BR322进行了酶学分析并利用原子力显微镜(AFM)对新形成的D NA结构进行了观察和比较.在所有已检测的限制酶中只有PstⅠ可以切割质粒p BR322的Ⅳ型DNA分子,说明在这种变性的DNA分子中仍存在少数完整的限制酶识别位点.与碱变性DNA分子的闭合环状结构相反,AFM成像的结果显示PstⅠ处理后的DNAⅣ分子均为开放结构,同时这种分子包含明显的DNA结节.与DNAⅣ分子相比,这种D NA分子的表观长度缩短了大约11%.有意思的是,大肠杆菌拓扑异构酶Ⅳ(一种Ⅱ型拓扑异构酶)也可以在p BR322 DNAⅣ分子中引入分子内结节,而这种结节D NA分子仍然保持闭合状态.AFM的结果表明上述两种结节的DNA分子在表观长度及结节结构的尺寸上均比较相似.这些发现证实,在碱变性的超螺旋DNA分子中仍然保留着一些长度较短的、含有特异性碱基配对的D NA双链区,而在这些区域内的D NA双链断裂可以导致D NA结节.
【英文摘要】 Combinatorial analyses including enzymatic analysis and atomic force microscopy(AFM) were used to gain more insights into structure of the alkali-denatured plasmid p BR322 DNA(DNA Ⅳ).Among the restriction enzymes tested,PstⅠ was able to cleave the p BR322 DNA Ⅳ molecules,indicative of the existence of an intact restriction site in the denatured DNA.AFM images revealed that PstⅠ-treated DNA Ⅳ molecules contained an individual node.The contour length of the condensed molecules was decreased by about 11% compa...
【基金】 supported by grants from The National Natural Science Foundation of China(31270124,30900023)~~
【更新日期】 2016-08-19
【分类号】 Q523
【正文快照】 DNA is the most important genetic material of thecellular organisms.The structure of DNA has greateffects on its functions in cells.A double-strandedDNA molecule has been demonstrated to be one of thethree structural forms:supercoiled DNA(DNAⅠ),relaxed o

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